Protein–RNA interactions for Protein: P36000

APL2, AP-1 complex subunit beta-1, yeastyeast

Predicted RBP Predictions only

Length 726 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
APL2P36000 YAR066WYAR066W 612 nt5.54□□□□□ -1.52
APL2P36000 YNG1YOR064C 660 nt5.54□□□□□ -1.52
APL2P36000 GLT1YDL171C 6438 nt5.53□□□□□ -1.52
APL2P36000 GRE3YHR104W 984 nt5.53□□□□□ -1.52
APL2P36000 HPM1YIL110W 1134 nt5.53□□□□□ -1.52
APL2P36000 YKL023WYKL023W 834 nt5.53□□□□□ -1.52
APL2P36000 CPR6YLR216C 1116 nt5.53□□□□□ -1.52
APL2P36000 SNO1YMR095C 675 nt5.53□□□□□ -1.52
APL2P36000 ERG29YMR134W 714 nt5.53□□□□□ -1.52
APL2P36000 ECM33YBR078W 1290 nt5.53□□□□□ -1.52
APL2P36000 NMD3YHR170W 1557 nt5.53□□□□□ -1.52
APL2P36000 RIT1YMR283C 1542 nt5.53□□□□□ -1.52
APL2P36000 CPS1YJL172W 1731 nt5.52□□□□□ -1.53
APL2P36000 YDR133CYDR133C 336 nt5.52□□□□□ -1.53
APL2P36000 YGL185CYGL185C 1140 nt5.52□□□□□ -1.53
APL2P36000 PAN5YHR063C 1140 nt5.52□□□□□ -1.53
APL2P36000 AIR1YIL079C 1083 nt5.52□□□□□ -1.53
APL2P36000 YIL089WYIL089W 618 nt5.52□□□□□ -1.53
APL2P36000 RCE1YMR274C 948 nt5.52□□□□□ -1.53
APL2P36000 GSP2YOR185C 663 nt5.52□□□□□ -1.53
APL2P36000 YDL109CYDL109C 1944 nt5.52□□□□□ -1.53
APL2P36000 FRS1YLR060W 1788 nt5.52□□□□□ -1.53
APL2P36000 CLN2YPL256C 1638 nt5.52□□□□□ -1.53
APL2P36000 DUR1,2YBR208C 5508 nt5.52□□□□□ -1.53
APL2P36000 DEG1YFL001W 1329 nt5.51□□□□□ -1.53
APL2P36000 RPC53YDL150W 1269 nt5.51□□□□□ -1.53
APL2P36000 EBP2YKL172W 1284 nt5.51□□□□□ -1.53
APL2P36000 THI80YOR143C 960 nt5.51□□□□□ -1.53
APL2P36000 YPR015CYPR015C 744 nt5.51□□□□□ -1.53
APL2P36000 SPN1YPR133C 1233 nt5.51□□□□□ -1.53
APL2P36000 PRR2YDL214C 2100 nt5.51□□□□□ -1.53
APL2P36000 ESF1YDR365C 1887 nt5.51□□□□□ -1.53
APL2P36000 NUR1YDL089W 1455 nt5.51□□□□□ -1.53
APL2P36000 GWT1YJL091C 1473 nt5.51□□□□□ -1.53
APL2P36000 MPH2YDL247W 1830 nt5.51□□□□□ -1.53
APL2P36000 RCK2YLR248W 1833 nt5.51□□□□□ -1.53
APL2P36000 KGD1YIL125W 3045 nt5.5□□□□□ -1.53
APL2P36000 UBA2YDR390C 1911 nt5.5□□□□□ -1.53
APL2P36000 SEC39YLR440C 2130 nt5.5□□□□□ -1.53
APL2P36000 YDL183CYDL183C 963 nt5.5□□□□□ -1.53
APL2P36000 CNL1YDR357C 369 nt5.5□□□□□ -1.53
APL2P36000 GRX4YER174C 735 nt5.5□□□□□ -1.53
APL2P36000 PCT1YGR202C 1275 nt5.5□□□□□ -1.53
APL2P36000 tS(AGA)D3tS(AGA)D3 83 nt5.5□□□□□ -1.53
APL2P36000 YAL064WYAL064W 285 nt5.5□□□□□ -1.53
APL2P36000 RPS0BYLR048W 759 nt5.5□□□□□ -1.53
APL2P36000 URA4YLR420W 1095 nt5.5□□□□□ -1.53
APL2P36000 CSI1YMR025W 888 nt5.5□□□□□ -1.53
APL2P36000 GDT1YBR187W 843 nt5.5□□□□□ -1.53
APL2P36000 SRB6YBR253W 366 nt5.5□□□□□ -1.53
APL2P36000 PRD1YCL057W 2139 nt5.5□□□□□ -1.53
APL2P36000 SEO1YAL067C 1782 nt5.5□□□□□ -1.53
APL2P36000 PXA1YPL147W 2613 nt5.49□□□□□ -1.53
APL2P36000 TRM8YDL201W 861 nt5.49□□□□□ -1.53
APL2P36000 YJR085CYJR085C 318 nt5.49□□□□□ -1.53
APL2P36000 PRP19YLL036C 1512 nt5.48□□□□□ -1.53
APL2P36000 FOX2YKR009C 2703 nt5.48□□□□□ -1.53
APL2P36000 TSL1YML100W 3297 nt5.48□□□□□ -1.53
APL2P36000 SED4YCR067C 3198 nt5.48□□□□□ -1.53
APL2P36000 MET12YPL023C 1974 nt5.48□□□□□ -1.53
APL2P36000 SNA2YDR525W-A 240 nt5.48□□□□□ -1.53
APL2P36000 YEL067CYEL067C 588 nt5.48□□□□□ -1.53
APL2P36000 DID4YKL002W 699 nt5.48□□□□□ -1.53
APL2P36000 GMH1YKR030W 822 nt5.48□□□□□ -1.53
APL2P36000 ATG16YMR159C 453 nt5.48□□□□□ -1.53
APL2P36000 snR19snR19 568 nt5.48□□□□□ -1.53
APL2P36000 STE20YHL007C 2820 nt5.47□□□□□ -1.53
APL2P36000 FRT2YAL028W 1587 nt5.47□□□□□ -1.53
APL2P36000 SAP4YGL229C 2457 nt5.47□□□□□ -1.53
APL2P36000 ARG4YHR018C 1392 nt5.47□□□□□ -1.53
APL2P36000 AAD4YDL243C 990 nt5.47□□□□□ -1.53
APL2P36000 YGL218WYGL218W 651 nt5.47□□□□□ -1.53
APL2P36000 ARG3YJL088W 1017 nt5.47□□□□□ -1.53
APL2P36000 RFU1YLR073C 603 nt5.47□□□□□ -1.53
APL2P36000 YLR365WYLR365W 333 nt5.47□□□□□ -1.53
APL2P36000 RRN9YMR270C 1098 nt5.47□□□□□ -1.53
APL2P36000 YBR292CYBR292C 372 nt5.47□□□□□ -1.53
APL2P36000 ARG82YDR173C 1068 nt5.46□□□□□ -1.54
APL2P36000 UBC8YEL012W 657 nt5.46□□□□□ -1.54
APL2P36000 COA3YJL062W-A 258 nt5.46□□□□□ -1.54
APL2P36000 SPC3YLR066W 555 nt5.46□□□□□ -1.54
APL2P36000 YOR062CYOR062C 807 nt5.46□□□□□ -1.54
APL2P36000 NRG2YBR066C 663 nt5.46□□□□□ -1.54
APL2P36000 RRB1YMR131C 1536 nt5.46□□□□□ -1.54
APL2P36000 TEC1YBR083W 1461 nt5.45□□□□□ -1.54
APL2P36000 YLR345WYLR345W 1530 nt5.45□□□□□ -1.54
APL2P36000 CAF4YKR036C 1932 nt5.45□□□□□ -1.54
APL2P36000 KRE28YDR532C 1158 nt5.45□□□□□ -1.54
APL2P36000 TIM21YGR033C 720 nt5.45□□□□□ -1.54
APL2P36000 YIL165CYIL165C 360 nt5.45□□□□□ -1.54
APL2P36000 YML094C-AYML094C-A 402 nt5.45□□□□□ -1.54
APL2P36000 MDY2YOL111C 639 nt5.45□□□□□ -1.54
APL2P36000 YOR379CYOR379C 339 nt5.45□□□□□ -1.54
APL2P36000 HAT1YPL001W 1125 nt5.45□□□□□ -1.54
APL2P36000 RIM15YFL033C 5313 nt5.45□□□□□ -1.54
APL2P36000 THI22YPR121W 1719 nt5.45□□□□□ -1.54
APL2P36000 OCA5YHL029C 2040 nt5.45□□□□□ -1.54
APL2P36000 RTC1YOL138C 4026 nt5.44□□□□□ -1.54
APL2P36000 TMN2YDR107C 2019 nt5.44□□□□□ -1.54
APL2P36000 YER133W-AYER133W-A 342 nt5.44□□□□□ -1.54
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 31.7 ms