Protein–RNA interactions for Protein: P35716

SOX11, Transcription factor SOX-11, humanhuman

Predictions only

Length 441 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOX11P35716 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SOX11P35716 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SOX11P35716 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SOX11P35716 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SOX11P35716 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SOX11P35716 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SOX11P35716 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SOX11P35716 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SOX11P35716 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SOX11P35716 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SOX11P35716 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
SOX11P35716 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SOX11P35716 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SOX11P35716 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SOX11P35716 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
SOX11P35716 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SOX11P35716 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SOX11P35716 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SOX11P35716 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SOX11P35716 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SOX11P35716 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SOX11P35716 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SOX11P35716 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SOX11P35716 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SOX11P35716 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SOX11P35716 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SOX11P35716 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SOX11P35716 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SOX11P35716 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SOX11P35716 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SOX11P35716 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SOX11P35716 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SOX11P35716 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
SOX11P35716 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SOX11P35716 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SOX11P35716 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SOX11P35716 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SOX11P35716 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SOX11P35716 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SOX11P35716 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
SOX11P35716 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
SOX11P35716 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
SOX11P35716 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
SOX11P35716 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SOX11P35716 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SOX11P35716 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SOX11P35716 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SOX11P35716 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SOX11P35716 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SOX11P35716 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SOX11P35716 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SOX11P35716 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SOX11P35716 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
SOX11P35716 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SOX11P35716 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SOX11P35716 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
SOX11P35716 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SOX11P35716 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SOX11P35716 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SOX11P35716 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
SOX11P35716 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SOX11P35716 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SOX11P35716 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SOX11P35716 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SOX11P35716 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SOX11P35716 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SOX11P35716 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SOX11P35716 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SOX11P35716 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SOX11P35716 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SOX11P35716 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SOX11P35716 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SOX11P35716 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SOX11P35716 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SOX11P35716 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SOX11P35716 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SOX11P35716 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SOX11P35716 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SOX11P35716 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SOX11P35716 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SOX11P35716 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
SOX11P35716 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
SOX11P35716 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SOX11P35716 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SOX11P35716 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SOX11P35716 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SOX11P35716 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SOX11P35716 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SOX11P35716 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SOX11P35716 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SOX11P35716 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SOX11P35716 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SOX11P35716 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SOX11P35716 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SOX11P35716 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SOX11P35716 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SOX11P35716 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SOX11P35716 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SOX11P35716 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SOX11P35716 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.6 ms