Protein–RNA interactions for Protein: P35658

NUP214, Nuclear pore complex protein Nup214, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 2,090 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP214P35658 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
NUP214P35658 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
NUP214P35658 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
NUP214P35658 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
NUP214P35658 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
NUP214P35658 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
NUP214P35658 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
NUP214P35658 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
NUP214P35658 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
NUP214P35658 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
NUP214P35658 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC21.08■□□□□ 0.96
NUP214P35658 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
NUP214P35658 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.96
NUP214P35658 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
NUP214P35658 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
NUP214P35658 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
NUP214P35658 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC21.08■□□□□ 0.96
NUP214P35658 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
NUP214P35658 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
NUP214P35658 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
NUP214P35658 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
NUP214P35658 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
NUP214P35658 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
NUP214P35658 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
NUP214P35658 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
NUP214P35658 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
NUP214P35658 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
NUP214P35658 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
NUP214P35658 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
NUP214P35658 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
NUP214P35658 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
NUP214P35658 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
NUP214P35658 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
NUP214P35658 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
NUP214P35658 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
NUP214P35658 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
NUP214P35658 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
NUP214P35658 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
NUP214P35658 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
NUP214P35658 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
NUP214P35658 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
NUP214P35658 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
NUP214P35658 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
NUP214P35658 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
NUP214P35658 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
NUP214P35658 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
NUP214P35658 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
NUP214P35658 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
NUP214P35658 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
NUP214P35658 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
NUP214P35658 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC21.05■□□□□ 0.96
NUP214P35658 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
NUP214P35658 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
NUP214P35658 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
NUP214P35658 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
NUP214P35658 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
NUP214P35658 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
NUP214P35658 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
NUP214P35658 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
NUP214P35658 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
NUP214P35658 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
NUP214P35658 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
NUP214P35658 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
NUP214P35658 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
NUP214P35658 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
NUP214P35658 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
NUP214P35658 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
NUP214P35658 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
NUP214P35658 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
NUP214P35658 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
NUP214P35658 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
NUP214P35658 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
NUP214P35658 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
NUP214P35658 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
NUP214P35658 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
NUP214P35658 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
NUP214P35658 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
NUP214P35658 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
NUP214P35658 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
NUP214P35658 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
NUP214P35658 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
NUP214P35658 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
NUP214P35658 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
NUP214P35658 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
NUP214P35658 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
NUP214P35658 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
NUP214P35658 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
NUP214P35658 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
NUP214P35658 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
NUP214P35658 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
NUP214P35658 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
NUP214P35658 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.96
NUP214P35658 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
NUP214P35658 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
NUP214P35658 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
NUP214P35658 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
NUP214P35658 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
NUP214P35658 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
NUP214P35658 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
NUP214P35658 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.6 ms