Protein–RNA interactions for Protein: P35609

ACTN2, Alpha-actinin-2, humanhuman

Predictions only

Length 894 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTN2P35609 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ACTN2P35609 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ACTN2P35609 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ACTN2P35609 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ACTN2P35609 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ACTN2P35609 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ACTN2P35609 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ACTN2P35609 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ACTN2P35609 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ACTN2P35609 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ACTN2P35609 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ACTN2P35609 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
ACTN2P35609 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ACTN2P35609 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ACTN2P35609 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ACTN2P35609 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ACTN2P35609 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ACTN2P35609 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ACTN2P35609 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ACTN2P35609 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ACTN2P35609 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ACTN2P35609 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ACTN2P35609 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ACTN2P35609 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ACTN2P35609 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ACTN2P35609 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
ACTN2P35609 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ACTN2P35609 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
ACTN2P35609 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
ACTN2P35609 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
ACTN2P35609 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
ACTN2P35609 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
ACTN2P35609 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ACTN2P35609 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ACTN2P35609 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ACTN2P35609 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ACTN2P35609 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ACTN2P35609 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ACTN2P35609 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ACTN2P35609 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ACTN2P35609 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ACTN2P35609 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ACTN2P35609 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ACTN2P35609 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ACTN2P35609 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ACTN2P35609 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ACTN2P35609 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ACTN2P35609 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ACTN2P35609 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ACTN2P35609 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ACTN2P35609 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ACTN2P35609 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ACTN2P35609 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ACTN2P35609 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ACTN2P35609 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ACTN2P35609 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ACTN2P35609 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ACTN2P35609 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ACTN2P35609 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ACTN2P35609 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ACTN2P35609 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
ACTN2P35609 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ACTN2P35609 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ACTN2P35609 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ACTN2P35609 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ACTN2P35609 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
ACTN2P35609 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ACTN2P35609 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ACTN2P35609 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ACTN2P35609 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ACTN2P35609 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
ACTN2P35609 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
ACTN2P35609 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ACTN2P35609 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ACTN2P35609 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ACTN2P35609 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ACTN2P35609 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ACTN2P35609 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ACTN2P35609 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ACTN2P35609 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ACTN2P35609 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ACTN2P35609 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ACTN2P35609 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ACTN2P35609 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ACTN2P35609 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ACTN2P35609 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ACTN2P35609 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ACTN2P35609 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ACTN2P35609 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ACTN2P35609 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ACTN2P35609 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ACTN2P35609 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ACTN2P35609 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ACTN2P35609 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ACTN2P35609 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ACTN2P35609 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ACTN2P35609 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ACTN2P35609 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ACTN2P35609 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ACTN2P35609 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.8 ms