Protein–RNA interactions for Protein: P35499

SCN4A, Sodium channel protein type 4 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 1,836 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN4AP35499 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
SCN4AP35499 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
SCN4AP35499 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
SCN4AP35499 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
SCN4AP35499 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
SCN4AP35499 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
SCN4AP35499 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
SCN4AP35499 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
SCN4AP35499 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
SCN4AP35499 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
SCN4AP35499 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
SCN4AP35499 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
SCN4AP35499 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
SCN4AP35499 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
SCN4AP35499 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
SCN4AP35499 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
SCN4AP35499 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
SCN4AP35499 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
SCN4AP35499 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC26.92■■□□□ 1.9
SCN4AP35499 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
SCN4AP35499 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
SCN4AP35499 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
SCN4AP35499 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
SCN4AP35499 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
SCN4AP35499 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
SCN4AP35499 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
SCN4AP35499 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC26.91■■□□□ 1.9
SCN4AP35499 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
SCN4AP35499 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
SCN4AP35499 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
SCN4AP35499 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
SCN4AP35499 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SCN4AP35499 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
SCN4AP35499 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
SCN4AP35499 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SCN4AP35499 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SCN4AP35499 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC26.9■■□□□ 1.9
SCN4AP35499 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SCN4AP35499 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC26.9■■□□□ 1.9
SCN4AP35499 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SCN4AP35499 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SCN4AP35499 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
SCN4AP35499 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SCN4AP35499 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SCN4AP35499 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
SCN4AP35499 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
SCN4AP35499 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
SCN4AP35499 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
SCN4AP35499 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
SCN4AP35499 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
SCN4AP35499 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SCN4AP35499 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
SCN4AP35499 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC26.88■■□□□ 1.89
SCN4AP35499 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
SCN4AP35499 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
SCN4AP35499 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
SCN4AP35499 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SCN4AP35499 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SCN4AP35499 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
SCN4AP35499 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
SCN4AP35499 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SCN4AP35499 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SCN4AP35499 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
SCN4AP35499 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
SCN4AP35499 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SCN4AP35499 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SCN4AP35499 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SCN4AP35499 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SCN4AP35499 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
SCN4AP35499 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
SCN4AP35499 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SCN4AP35499 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
SCN4AP35499 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
SCN4AP35499 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
SCN4AP35499 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
SCN4AP35499 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SCN4AP35499 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
SCN4AP35499 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SCN4AP35499 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SCN4AP35499 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
SCN4AP35499 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SCN4AP35499 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SCN4AP35499 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
SCN4AP35499 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
SCN4AP35499 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
SCN4AP35499 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
SCN4AP35499 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SCN4AP35499 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
SCN4AP35499 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
SCN4AP35499 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
SCN4AP35499 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
SCN4AP35499 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC26.83■■□□□ 1.89
SCN4AP35499 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
SCN4AP35499 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC26.83■■□□□ 1.89
SCN4AP35499 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
SCN4AP35499 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
SCN4AP35499 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC26.83■■□□□ 1.89
SCN4AP35499 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
SCN4AP35499 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
SCN4AP35499 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15 ms