Protein–RNA interactions for Protein: P35443

THBS4, Thrombospondin-4, humanhuman

Predictions only

Length 961 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
THBS4P35443 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
THBS4P35443 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
THBS4P35443 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
THBS4P35443 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
THBS4P35443 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
THBS4P35443 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
THBS4P35443 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
THBS4P35443 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
THBS4P35443 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
THBS4P35443 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
THBS4P35443 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
THBS4P35443 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
THBS4P35443 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
THBS4P35443 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
THBS4P35443 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC19.58■□□□□ 0.72
THBS4P35443 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
THBS4P35443 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
THBS4P35443 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
THBS4P35443 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
THBS4P35443 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
THBS4P35443 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
THBS4P35443 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
THBS4P35443 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
THBS4P35443 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
THBS4P35443 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
THBS4P35443 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
THBS4P35443 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
THBS4P35443 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
THBS4P35443 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
THBS4P35443 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
THBS4P35443 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
THBS4P35443 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
THBS4P35443 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
THBS4P35443 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
THBS4P35443 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
THBS4P35443 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
THBS4P35443 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
THBS4P35443 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
THBS4P35443 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
THBS4P35443 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
THBS4P35443 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
THBS4P35443 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
THBS4P35443 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
THBS4P35443 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
THBS4P35443 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
THBS4P35443 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
THBS4P35443 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
THBS4P35443 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
THBS4P35443 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
THBS4P35443 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
THBS4P35443 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
THBS4P35443 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
THBS4P35443 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC19.55■□□□□ 0.72
THBS4P35443 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
THBS4P35443 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
THBS4P35443 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
THBS4P35443 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
THBS4P35443 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
THBS4P35443 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
THBS4P35443 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
THBS4P35443 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC19.54■□□□□ 0.72
THBS4P35443 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
THBS4P35443 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
THBS4P35443 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
THBS4P35443 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
THBS4P35443 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
THBS4P35443 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
THBS4P35443 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
THBS4P35443 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
THBS4P35443 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
THBS4P35443 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
THBS4P35443 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
THBS4P35443 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC19.53■□□□□ 0.72
THBS4P35443 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
THBS4P35443 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
THBS4P35443 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
THBS4P35443 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
THBS4P35443 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
THBS4P35443 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
THBS4P35443 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
THBS4P35443 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
THBS4P35443 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
THBS4P35443 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
THBS4P35443 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
THBS4P35443 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC19.52■□□□□ 0.72
THBS4P35443 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
THBS4P35443 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
THBS4P35443 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
THBS4P35443 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
THBS4P35443 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
THBS4P35443 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
THBS4P35443 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
THBS4P35443 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
THBS4P35443 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
THBS4P35443 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
THBS4P35443 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
THBS4P35443 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
THBS4P35443 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
THBS4P35443 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
THBS4P35443 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16 ms