Protein–RNA interactions for Protein: P35241

RDX, Radixin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 583 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RDXP35241 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
RDXP35241 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
RDXP35241 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
RDXP35241 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
RDXP35241 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
RDXP35241 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
RDXP35241 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
RDXP35241 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
RDXP35241 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
RDXP35241 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
RDXP35241 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
RDXP35241 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
RDXP35241 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
RDXP35241 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
RDXP35241 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
RDXP35241 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
RDXP35241 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
RDXP35241 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
RDXP35241 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
RDXP35241 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
RDXP35241 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
RDXP35241 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
RDXP35241 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
RDXP35241 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
RDXP35241 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
RDXP35241 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
RDXP35241 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
RDXP35241 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
RDXP35241 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
RDXP35241 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
RDXP35241 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
RDXP35241 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
RDXP35241 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RDXP35241 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
RDXP35241 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
RDXP35241 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RDXP35241 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
RDXP35241 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
RDXP35241 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
RDXP35241 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
RDXP35241 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
RDXP35241 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
RDXP35241 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RDXP35241 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
RDXP35241 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
RDXP35241 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
RDXP35241 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
RDXP35241 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
RDXP35241 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
RDXP35241 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
RDXP35241 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
RDXP35241 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
RDXP35241 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
RDXP35241 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
RDXP35241 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
RDXP35241 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
RDXP35241 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
RDXP35241 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
RDXP35241 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RDXP35241 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
RDXP35241 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RDXP35241 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RDXP35241 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RDXP35241 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RDXP35241 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RDXP35241 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RDXP35241 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RDXP35241 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RDXP35241 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RDXP35241 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
RDXP35241 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RDXP35241 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
RDXP35241 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
RDXP35241 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
RDXP35241 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
RDXP35241 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RDXP35241 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
RDXP35241 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RDXP35241 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RDXP35241 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
RDXP35241 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RDXP35241 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RDXP35241 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
RDXP35241 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
RDXP35241 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
RDXP35241 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
RDXP35241 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RDXP35241 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
RDXP35241 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
RDXP35241 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
RDXP35241 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
RDXP35241 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
RDXP35241 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
RDXP35241 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
RDXP35241 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
RDXP35241 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
RDXP35241 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
RDXP35241 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
RDXP35241 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RDXP35241 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.4 ms