Protein–RNA interactions for Protein: P33241

LSP1, Lymphocyte-specific protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LSP1P33241 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
LSP1P33241 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
LSP1P33241 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
LSP1P33241 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
LSP1P33241 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
LSP1P33241 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
LSP1P33241 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
LSP1P33241 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
LSP1P33241 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LSP1P33241 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LSP1P33241 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LSP1P33241 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LSP1P33241 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LSP1P33241 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LSP1P33241 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LSP1P33241 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LSP1P33241 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LSP1P33241 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LSP1P33241 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
LSP1P33241 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
LSP1P33241 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LSP1P33241 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LSP1P33241 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LSP1P33241 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
LSP1P33241 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LSP1P33241 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LSP1P33241 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LSP1P33241 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LSP1P33241 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
LSP1P33241 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LSP1P33241 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
LSP1P33241 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
LSP1P33241 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LSP1P33241 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
LSP1P33241 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LSP1P33241 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LSP1P33241 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LSP1P33241 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LSP1P33241 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LSP1P33241 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LSP1P33241 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
LSP1P33241 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LSP1P33241 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LSP1P33241 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LSP1P33241 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LSP1P33241 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
LSP1P33241 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LSP1P33241 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LSP1P33241 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
LSP1P33241 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LSP1P33241 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
LSP1P33241 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
LSP1P33241 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
LSP1P33241 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
LSP1P33241 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
LSP1P33241 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
LSP1P33241 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
LSP1P33241 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
LSP1P33241 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
LSP1P33241 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
LSP1P33241 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
LSP1P33241 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LSP1P33241 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LSP1P33241 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LSP1P33241 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LSP1P33241 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LSP1P33241 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LSP1P33241 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LSP1P33241 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LSP1P33241 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LSP1P33241 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LSP1P33241 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LSP1P33241 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LSP1P33241 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LSP1P33241 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LSP1P33241 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LSP1P33241 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LSP1P33241 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LSP1P33241 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LSP1P33241 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LSP1P33241 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LSP1P33241 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LSP1P33241 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LSP1P33241 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LSP1P33241 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LSP1P33241 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LSP1P33241 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LSP1P33241 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LSP1P33241 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LSP1P33241 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LSP1P33241 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LSP1P33241 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LSP1P33241 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LSP1P33241 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LSP1P33241 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LSP1P33241 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LSP1P33241 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LSP1P33241 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LSP1P33241 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LSP1P33241 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.2 ms