Protein–RNA interactions for Protein: P31327

CPS1, Carbamoyl-phosphate synthase [ammonia], mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 1,500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPS1P31327 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.05■■■□□ 2.72
CPS1P31327 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
CPS1P31327 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC32.05■■■□□ 2.72
CPS1P31327 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
CPS1P31327 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC32.05■■■□□ 2.72
CPS1P31327 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.04■■■□□ 2.72
CPS1P31327 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.04■■■□□ 2.72
CPS1P31327 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC32.04■■■□□ 2.72
CPS1P31327 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC32.04■■■□□ 2.72
CPS1P31327 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
CPS1P31327 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
CPS1P31327 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC32.03■■■□□ 2.72
CPS1P31327 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
CPS1P31327 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.03■■■□□ 2.72
CPS1P31327 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
CPS1P31327 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC32.03■■■□□ 2.72
CPS1P31327 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC32.03■■■□□ 2.72
CPS1P31327 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.02■■■□□ 2.72
CPS1P31327 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC32.02■■■□□ 2.72
CPS1P31327 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.02■■■□□ 2.72
CPS1P31327 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC32.02■■■□□ 2.72
CPS1P31327 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
CPS1P31327 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
CPS1P31327 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.02■■■□□ 2.72
CPS1P31327 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
CPS1P31327 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.72
CPS1P31327 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.72
CPS1P31327 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC32.01■■■□□ 2.72
CPS1P31327 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC32.01■■■□□ 2.72
CPS1P31327 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.72
CPS1P31327 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC32.01■■■□□ 2.72
CPS1P31327 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.71
CPS1P31327 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.71
CPS1P31327 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC32.01■■■□□ 2.71
CPS1P31327 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC32.01■■■□□ 2.71
CPS1P31327 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.71
CPS1P31327 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC32■■■□□ 2.71
CPS1P31327 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC32■■■□□ 2.71
CPS1P31327 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32■■■□□ 2.71
CPS1P31327 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC32■■■□□ 2.71
CPS1P31327 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
CPS1P31327 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC32■■■□□ 2.71
CPS1P31327 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
CPS1P31327 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
CPS1P31327 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC32■■■□□ 2.71
CPS1P31327 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC32■■■□□ 2.71
CPS1P31327 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
CPS1P31327 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC31.99■■■□□ 2.71
CPS1P31327 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
CPS1P31327 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
CPS1P31327 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.99■■■□□ 2.71
CPS1P31327 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
CPS1P31327 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
CPS1P31327 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
CPS1P31327 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
CPS1P31327 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
CPS1P31327 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.98■■■□□ 2.71
CPS1P31327 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.98■■■□□ 2.71
CPS1P31327 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC31.98■■■□□ 2.71
CPS1P31327 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC31.98■■■□□ 2.71
CPS1P31327 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC31.98■■■□□ 2.71
CPS1P31327 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
CPS1P31327 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC31.97■■■□□ 2.71
CPS1P31327 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC31.97■■■□□ 2.71
CPS1P31327 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.97■■■□□ 2.71
CPS1P31327 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.97■■■□□ 2.71
CPS1P31327 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.97■■■□□ 2.71
CPS1P31327 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC31.97■■■□□ 2.71
CPS1P31327 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.97■■■□□ 2.71
CPS1P31327 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
CPS1P31327 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC31.97■■■□□ 2.71
CPS1P31327 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC31.97■■■□□ 2.71
CPS1P31327 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC31.97■■■□□ 2.71
CPS1P31327 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC31.97■■■□□ 2.71
CPS1P31327 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC31.97■■■□□ 2.71
CPS1P31327 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
CPS1P31327 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.97■■■□□ 2.71
CPS1P31327 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC31.97■■■□□ 2.71
CPS1P31327 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC31.97■■■□□ 2.71
CPS1P31327 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
CPS1P31327 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC31.96■■■□□ 2.71
CPS1P31327 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
CPS1P31327 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
CPS1P31327 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC31.96■■■□□ 2.71
CPS1P31327 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
CPS1P31327 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
CPS1P31327 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC31.96■■■□□ 2.71
CPS1P31327 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC31.96■■■□□ 2.71
CPS1P31327 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.96■■■□□ 2.71
CPS1P31327 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.71
CPS1P31327 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC31.95■■■□□ 2.71
CPS1P31327 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.71
CPS1P31327 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.71
CPS1P31327 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.71
CPS1P31327 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.71
CPS1P31327 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.7
CPS1P31327 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC31.95■■■□□ 2.7
CPS1P31327 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.7
CPS1P31327 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC31.94■■■□□ 2.7
CPS1P31327 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms