Protein–RNA interactions for Protein: P30532

CHRNA5, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-5, humanhuman

Predictions only

Length 468 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA5P30532 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
CHRNA5P30532 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
CHRNA5P30532 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
CHRNA5P30532 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.05
CHRNA5P30532 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.05
CHRNA5P30532 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
CHRNA5P30532 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
CHRNA5P30532 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
CHRNA5P30532 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
CHRNA5P30532 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
CHRNA5P30532 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
CHRNA5P30532 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC27.87■■■□□ 2.05
CHRNA5P30532 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
CHRNA5P30532 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CHRNA5P30532 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
CHRNA5P30532 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
CHRNA5P30532 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CHRNA5P30532 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CHRNA5P30532 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
CHRNA5P30532 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CHRNA5P30532 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
CHRNA5P30532 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CHRNA5P30532 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC27.86■■■□□ 2.05
CHRNA5P30532 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
CHRNA5P30532 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CHRNA5P30532 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
CHRNA5P30532 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CHRNA5P30532 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CHRNA5P30532 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CHRNA5P30532 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
CHRNA5P30532 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CHRNA5P30532 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
CHRNA5P30532 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
CHRNA5P30532 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CHRNA5P30532 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CHRNA5P30532 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CHRNA5P30532 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
CHRNA5P30532 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
CHRNA5P30532 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
CHRNA5P30532 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CHRNA5P30532 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
CHRNA5P30532 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CHRNA5P30532 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CHRNA5P30532 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
CHRNA5P30532 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CHRNA5P30532 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CHRNA5P30532 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CHRNA5P30532 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
CHRNA5P30532 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
CHRNA5P30532 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CHRNA5P30532 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
CHRNA5P30532 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.04
CHRNA5P30532 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CHRNA5P30532 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CHRNA5P30532 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
CHRNA5P30532 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
CHRNA5P30532 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC27.82■■■□□ 2.04
CHRNA5P30532 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
CHRNA5P30532 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CHRNA5P30532 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
CHRNA5P30532 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CHRNA5P30532 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CHRNA5P30532 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CHRNA5P30532 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CHRNA5P30532 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CHRNA5P30532 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CHRNA5P30532 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
CHRNA5P30532 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
CHRNA5P30532 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CHRNA5P30532 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
CHRNA5P30532 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CHRNA5P30532 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC27.8■■■□□ 2.04
CHRNA5P30532 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
CHRNA5P30532 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
CHRNA5P30532 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CHRNA5P30532 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CHRNA5P30532 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CHRNA5P30532 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
CHRNA5P30532 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
CHRNA5P30532 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
CHRNA5P30532 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CHRNA5P30532 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC27.79■■■□□ 2.04
CHRNA5P30532 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
CHRNA5P30532 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
CHRNA5P30532 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
CHRNA5P30532 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
CHRNA5P30532 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CHRNA5P30532 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
CHRNA5P30532 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CHRNA5P30532 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CHRNA5P30532 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
CHRNA5P30532 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
CHRNA5P30532 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CHRNA5P30532 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CHRNA5P30532 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
CHRNA5P30532 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC27.77■■■□□ 2.04
CHRNA5P30532 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CHRNA5P30532 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
CHRNA5P30532 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CHRNA5P30532 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms