Protein–RNA interactions for Protein: P30085

CMPK1, UMP-CMP kinase, humanhuman

Predictions only

Length 196 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CMPK1P30085 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CMPK1P30085 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CMPK1P30085 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CMPK1P30085 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CMPK1P30085 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CMPK1P30085 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CMPK1P30085 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CMPK1P30085 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CMPK1P30085 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CMPK1P30085 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CMPK1P30085 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CMPK1P30085 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CMPK1P30085 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CMPK1P30085 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CMPK1P30085 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CMPK1P30085 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
CMPK1P30085 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
CMPK1P30085 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CMPK1P30085 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CMPK1P30085 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
CMPK1P30085 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
CMPK1P30085 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
CMPK1P30085 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
CMPK1P30085 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CMPK1P30085 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
CMPK1P30085 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CMPK1P30085 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CMPK1P30085 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CMPK1P30085 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CMPK1P30085 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CMPK1P30085 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
CMPK1P30085 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CMPK1P30085 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CMPK1P30085 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CMPK1P30085 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CMPK1P30085 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
CMPK1P30085 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CMPK1P30085 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CMPK1P30085 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CMPK1P30085 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CMPK1P30085 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CMPK1P30085 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CMPK1P30085 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CMPK1P30085 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CMPK1P30085 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CMPK1P30085 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CMPK1P30085 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CMPK1P30085 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
CMPK1P30085 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CMPK1P30085 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CMPK1P30085 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
CMPK1P30085 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CMPK1P30085 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CMPK1P30085 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CMPK1P30085 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CMPK1P30085 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CMPK1P30085 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CMPK1P30085 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CMPK1P30085 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CMPK1P30085 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CMPK1P30085 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CMPK1P30085 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
CMPK1P30085 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CMPK1P30085 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CMPK1P30085 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CMPK1P30085 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
CMPK1P30085 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CMPK1P30085 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CMPK1P30085 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CMPK1P30085 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CMPK1P30085 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CMPK1P30085 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CMPK1P30085 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CMPK1P30085 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CMPK1P30085 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
CMPK1P30085 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
CMPK1P30085 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CMPK1P30085 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CMPK1P30085 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CMPK1P30085 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CMPK1P30085 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CMPK1P30085 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CMPK1P30085 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CMPK1P30085 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CMPK1P30085 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CMPK1P30085 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CMPK1P30085 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CMPK1P30085 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CMPK1P30085 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CMPK1P30085 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CMPK1P30085 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CMPK1P30085 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CMPK1P30085 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CMPK1P30085 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CMPK1P30085 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CMPK1P30085 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CMPK1P30085 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CMPK1P30085 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CMPK1P30085 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CMPK1P30085 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms