Protein–RNA interactions for Protein: P30084

ECHS1, Enoyl-CoA hydratase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 290 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECHS1P30084 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ECHS1P30084 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ECHS1P30084 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ECHS1P30084 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ECHS1P30084 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
ECHS1P30084 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ECHS1P30084 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ECHS1P30084 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ECHS1P30084 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ECHS1P30084 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ECHS1P30084 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ECHS1P30084 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ECHS1P30084 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ECHS1P30084 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ECHS1P30084 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ECHS1P30084 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
ECHS1P30084 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ECHS1P30084 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
ECHS1P30084 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ECHS1P30084 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ECHS1P30084 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ECHS1P30084 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ECHS1P30084 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ECHS1P30084 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ECHS1P30084 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ECHS1P30084 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ECHS1P30084 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ECHS1P30084 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ECHS1P30084 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ECHS1P30084 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ECHS1P30084 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ECHS1P30084 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ECHS1P30084 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ECHS1P30084 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ECHS1P30084 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ECHS1P30084 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ECHS1P30084 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ECHS1P30084 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ECHS1P30084 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ECHS1P30084 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ECHS1P30084 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ECHS1P30084 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ECHS1P30084 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ECHS1P30084 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ECHS1P30084 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ECHS1P30084 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ECHS1P30084 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ECHS1P30084 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ECHS1P30084 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ECHS1P30084 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ECHS1P30084 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ECHS1P30084 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ECHS1P30084 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ECHS1P30084 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ECHS1P30084 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ECHS1P30084 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ECHS1P30084 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ECHS1P30084 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ECHS1P30084 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ECHS1P30084 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ECHS1P30084 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ECHS1P30084 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ECHS1P30084 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ECHS1P30084 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ECHS1P30084 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ECHS1P30084 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ECHS1P30084 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ECHS1P30084 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ECHS1P30084 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ECHS1P30084 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ECHS1P30084 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
ECHS1P30084 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ECHS1P30084 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ECHS1P30084 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ECHS1P30084 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ECHS1P30084 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ECHS1P30084 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ECHS1P30084 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ECHS1P30084 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ECHS1P30084 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ECHS1P30084 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ECHS1P30084 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ECHS1P30084 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ECHS1P30084 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ECHS1P30084 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ECHS1P30084 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ECHS1P30084 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ECHS1P30084 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ECHS1P30084 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ECHS1P30084 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ECHS1P30084 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ECHS1P30084 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ECHS1P30084 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ECHS1P30084 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ECHS1P30084 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ECHS1P30084 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ECHS1P30084 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ECHS1P30084 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ECHS1P30084 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ECHS1P30084 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms