Protein–RNA interactions for Protein: P29279

CTGF, Connective tissue growth factor, humanhuman

Predictions only

Length 349 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTGFP29279 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CTGFP29279 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CTGFP29279 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CTGFP29279 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CTGFP29279 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CTGFP29279 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CTGFP29279 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CTGFP29279 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CTGFP29279 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
CTGFP29279 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CTGFP29279 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CTGFP29279 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CTGFP29279 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CTGFP29279 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
CTGFP29279 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CTGFP29279 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CTGFP29279 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CTGFP29279 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CTGFP29279 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CTGFP29279 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
CTGFP29279 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CTGFP29279 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CTGFP29279 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CTGFP29279 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CTGFP29279 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
CTGFP29279 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CTGFP29279 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CTGFP29279 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CTGFP29279 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CTGFP29279 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CTGFP29279 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CTGFP29279 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CTGFP29279 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CTGFP29279 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CTGFP29279 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CTGFP29279 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CTGFP29279 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CTGFP29279 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CTGFP29279 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CTGFP29279 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CTGFP29279 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CTGFP29279 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CTGFP29279 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CTGFP29279 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CTGFP29279 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
CTGFP29279 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
CTGFP29279 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CTGFP29279 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CTGFP29279 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CTGFP29279 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CTGFP29279 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CTGFP29279 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CTGFP29279 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CTGFP29279 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CTGFP29279 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CTGFP29279 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CTGFP29279 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CTGFP29279 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CTGFP29279 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CTGFP29279 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CTGFP29279 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CTGFP29279 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
CTGFP29279 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CTGFP29279 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CTGFP29279 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CTGFP29279 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CTGFP29279 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CTGFP29279 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CTGFP29279 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CTGFP29279 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CTGFP29279 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CTGFP29279 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CTGFP29279 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CTGFP29279 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CTGFP29279 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CTGFP29279 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CTGFP29279 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CTGFP29279 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CTGFP29279 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
CTGFP29279 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CTGFP29279 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CTGFP29279 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CTGFP29279 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CTGFP29279 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CTGFP29279 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CTGFP29279 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CTGFP29279 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CTGFP29279 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CTGFP29279 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CTGFP29279 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CTGFP29279 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CTGFP29279 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
CTGFP29279 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CTGFP29279 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CTGFP29279 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CTGFP29279 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CTGFP29279 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CTGFP29279 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CTGFP29279 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CTGFP29279 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms