Protein–RNA interactions for Protein: P28340

POLD1, DNA polymerase delta catalytic subunit, humanhuman

Predictions only

Length 1,107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLD1P28340 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
POLD1P28340 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
POLD1P28340 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
POLD1P28340 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
POLD1P28340 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
POLD1P28340 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
POLD1P28340 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
POLD1P28340 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
POLD1P28340 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
POLD1P28340 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
POLD1P28340 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
POLD1P28340 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
POLD1P28340 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
POLD1P28340 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC28.25■■■□□ 2.11
POLD1P28340 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
POLD1P28340 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
POLD1P28340 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
POLD1P28340 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
POLD1P28340 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC28.24■■■□□ 2.11
POLD1P28340 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
POLD1P28340 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
POLD1P28340 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
POLD1P28340 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC28.24■■■□□ 2.11
POLD1P28340 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
POLD1P28340 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
POLD1P28340 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
POLD1P28340 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
POLD1P28340 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
POLD1P28340 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
POLD1P28340 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
POLD1P28340 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
POLD1P28340 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
POLD1P28340 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
POLD1P28340 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
POLD1P28340 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
POLD1P28340 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
POLD1P28340 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
POLD1P28340 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
POLD1P28340 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
POLD1P28340 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
POLD1P28340 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
POLD1P28340 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
POLD1P28340 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
POLD1P28340 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
POLD1P28340 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
POLD1P28340 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
POLD1P28340 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
POLD1P28340 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
POLD1P28340 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
POLD1P28340 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
POLD1P28340 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
POLD1P28340 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
POLD1P28340 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
POLD1P28340 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
POLD1P28340 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
POLD1P28340 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
POLD1P28340 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.11
POLD1P28340 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
POLD1P28340 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
POLD1P28340 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
POLD1P28340 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.1
POLD1P28340 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
POLD1P28340 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
POLD1P28340 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
POLD1P28340 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
POLD1P28340 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
POLD1P28340 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
POLD1P28340 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
POLD1P28340 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
POLD1P28340 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
POLD1P28340 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
POLD1P28340 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
POLD1P28340 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
POLD1P28340 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC28.18■■■□□ 2.1
POLD1P28340 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
POLD1P28340 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
POLD1P28340 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
POLD1P28340 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC28.18■■■□□ 2.1
POLD1P28340 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
POLD1P28340 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
POLD1P28340 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
POLD1P28340 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
POLD1P28340 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
POLD1P28340 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
POLD1P28340 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
POLD1P28340 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
POLD1P28340 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
POLD1P28340 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC28.17■■■□□ 2.1
POLD1P28340 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
POLD1P28340 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
POLD1P28340 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
POLD1P28340 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
POLD1P28340 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
POLD1P28340 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
POLD1P28340 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
POLD1P28340 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
POLD1P28340 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
POLD1P28340 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
POLD1P28340 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
POLD1P28340 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 89.3 ms