Protein–RNA interactions for Protein: P28067

HLA-DMA, HLA class II histocompatibility antigen, DM alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-DMAP28067 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
HLA-DMAP28067 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
HLA-DMAP28067 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
HLA-DMAP28067 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
HLA-DMAP28067 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
HLA-DMAP28067 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
HLA-DMAP28067 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
HLA-DMAP28067 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
HLA-DMAP28067 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
HLA-DMAP28067 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
HLA-DMAP28067 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
HLA-DMAP28067 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
HLA-DMAP28067 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
HLA-DMAP28067 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
HLA-DMAP28067 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
HLA-DMAP28067 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
HLA-DMAP28067 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
HLA-DMAP28067 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
HLA-DMAP28067 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
HLA-DMAP28067 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
HLA-DMAP28067 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
HLA-DMAP28067 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
HLA-DMAP28067 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
HLA-DMAP28067 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
HLA-DMAP28067 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
HLA-DMAP28067 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
HLA-DMAP28067 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
HLA-DMAP28067 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
HLA-DMAP28067 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
HLA-DMAP28067 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
HLA-DMAP28067 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
HLA-DMAP28067 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
HLA-DMAP28067 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
HLA-DMAP28067 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
HLA-DMAP28067 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
HLA-DMAP28067 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
HLA-DMAP28067 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
HLA-DMAP28067 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
HLA-DMAP28067 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
HLA-DMAP28067 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
HLA-DMAP28067 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
HLA-DMAP28067 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
HLA-DMAP28067 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
HLA-DMAP28067 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
HLA-DMAP28067 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
HLA-DMAP28067 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
HLA-DMAP28067 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
HLA-DMAP28067 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
HLA-DMAP28067 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
HLA-DMAP28067 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
HLA-DMAP28067 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
HLA-DMAP28067 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
HLA-DMAP28067 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
HLA-DMAP28067 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
HLA-DMAP28067 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
HLA-DMAP28067 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
HLA-DMAP28067 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
HLA-DMAP28067 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
HLA-DMAP28067 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
HLA-DMAP28067 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
HLA-DMAP28067 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
HLA-DMAP28067 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC19.25■□□□□ 0.67
HLA-DMAP28067 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
HLA-DMAP28067 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
HLA-DMAP28067 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
HLA-DMAP28067 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
HLA-DMAP28067 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
HLA-DMAP28067 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
HLA-DMAP28067 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
HLA-DMAP28067 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
HLA-DMAP28067 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
HLA-DMAP28067 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
HLA-DMAP28067 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
HLA-DMAP28067 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
HLA-DMAP28067 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
HLA-DMAP28067 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
HLA-DMAP28067 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
HLA-DMAP28067 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
HLA-DMAP28067 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
HLA-DMAP28067 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
HLA-DMAP28067 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
HLA-DMAP28067 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
HLA-DMAP28067 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
HLA-DMAP28067 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
HLA-DMAP28067 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
HLA-DMAP28067 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
HLA-DMAP28067 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC19.23■□□□□ 0.67
HLA-DMAP28067 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC19.23■□□□□ 0.67
HLA-DMAP28067 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
HLA-DMAP28067 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
HLA-DMAP28067 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
HLA-DMAP28067 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
HLA-DMAP28067 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
HLA-DMAP28067 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
HLA-DMAP28067 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
HLA-DMAP28067 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
HLA-DMAP28067 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
HLA-DMAP28067 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
HLA-DMAP28067 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
HLA-DMAP28067 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms