Protein–RNA interactions for Protein: P26951

IL3RA, Interleukin-3 receptor subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 378 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IL3RAP26951 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
IL3RAP26951 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
IL3RAP26951 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
IL3RAP26951 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
IL3RAP26951 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
IL3RAP26951 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
IL3RAP26951 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
IL3RAP26951 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
IL3RAP26951 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
IL3RAP26951 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
IL3RAP26951 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
IL3RAP26951 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
IL3RAP26951 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
IL3RAP26951 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
IL3RAP26951 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
IL3RAP26951 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
IL3RAP26951 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
IL3RAP26951 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
IL3RAP26951 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
IL3RAP26951 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
IL3RAP26951 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
IL3RAP26951 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
IL3RAP26951 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
IL3RAP26951 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
IL3RAP26951 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
IL3RAP26951 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
IL3RAP26951 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
IL3RAP26951 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
IL3RAP26951 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
IL3RAP26951 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
IL3RAP26951 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
IL3RAP26951 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
IL3RAP26951 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
IL3RAP26951 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
IL3RAP26951 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
IL3RAP26951 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
IL3RAP26951 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
IL3RAP26951 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
IL3RAP26951 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
IL3RAP26951 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
IL3RAP26951 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
IL3RAP26951 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
IL3RAP26951 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
IL3RAP26951 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
IL3RAP26951 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
IL3RAP26951 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
IL3RAP26951 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
IL3RAP26951 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
IL3RAP26951 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
IL3RAP26951 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
IL3RAP26951 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
IL3RAP26951 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
IL3RAP26951 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
IL3RAP26951 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
IL3RAP26951 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
IL3RAP26951 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
IL3RAP26951 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
IL3RAP26951 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
IL3RAP26951 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
IL3RAP26951 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
IL3RAP26951 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
IL3RAP26951 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
IL3RAP26951 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
IL3RAP26951 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
IL3RAP26951 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
IL3RAP26951 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
IL3RAP26951 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
IL3RAP26951 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
IL3RAP26951 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
IL3RAP26951 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
IL3RAP26951 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
IL3RAP26951 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
IL3RAP26951 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
IL3RAP26951 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
IL3RAP26951 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
IL3RAP26951 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
IL3RAP26951 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
IL3RAP26951 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
IL3RAP26951 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
IL3RAP26951 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
IL3RAP26951 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
IL3RAP26951 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
IL3RAP26951 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
IL3RAP26951 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
IL3RAP26951 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
IL3RAP26951 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
IL3RAP26951 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
IL3RAP26951 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
IL3RAP26951 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
IL3RAP26951 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
IL3RAP26951 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
IL3RAP26951 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
IL3RAP26951 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
IL3RAP26951 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
IL3RAP26951 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
IL3RAP26951 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
IL3RAP26951 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
IL3RAP26951 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
IL3RAP26951 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
IL3RAP26951 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.8 ms