Protein–RNA interactions for Protein: P26678

PLN, Cardiac phospholamban, humanhuman

Predictions only

Length 52 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLNP26678 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PLNP26678 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PLNP26678 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PLNP26678 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
PLNP26678 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PLNP26678 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PLNP26678 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PLNP26678 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PLNP26678 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
PLNP26678 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
PLNP26678 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
PLNP26678 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PLNP26678 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PLNP26678 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PLNP26678 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PLNP26678 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PLNP26678 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PLNP26678 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PLNP26678 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PLNP26678 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PLNP26678 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PLNP26678 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PLNP26678 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PLNP26678 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PLNP26678 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PLNP26678 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PLNP26678 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PLNP26678 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PLNP26678 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PLNP26678 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PLNP26678 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PLNP26678 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PLNP26678 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PLNP26678 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
PLNP26678 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PLNP26678 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PLNP26678 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PLNP26678 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
PLNP26678 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
PLNP26678 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PLNP26678 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
PLNP26678 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PLNP26678 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PLNP26678 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PLNP26678 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PLNP26678 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PLNP26678 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PLNP26678 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PLNP26678 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PLNP26678 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
PLNP26678 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PLNP26678 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
PLNP26678 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PLNP26678 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
PLNP26678 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PLNP26678 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
PLNP26678 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
PLNP26678 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PLNP26678 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PLNP26678 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PLNP26678 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PLNP26678 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PLNP26678 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PLNP26678 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PLNP26678 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PLNP26678 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PLNP26678 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PLNP26678 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PLNP26678 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PLNP26678 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
PLNP26678 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PLNP26678 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PLNP26678 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
PLNP26678 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
PLNP26678 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PLNP26678 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PLNP26678 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
PLNP26678 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PLNP26678 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
PLNP26678 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
PLNP26678 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PLNP26678 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PLNP26678 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PLNP26678 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
PLNP26678 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
PLNP26678 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PLNP26678 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PLNP26678 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PLNP26678 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PLNP26678 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
PLNP26678 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
PLNP26678 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PLNP26678 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
PLNP26678 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PLNP26678 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
PLNP26678 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
PLNP26678 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PLNP26678 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
PLNP26678 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PLNP26678 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms