Protein–RNA interactions for Protein: P26358

DNMT1, DNA (cytosine-5)-methyltransferase 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,616 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNMT1P26358 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC33.82■■■■□ 3.01
DNMT1P26358 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.82■■■■□ 3
DNMT1P26358 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC33.82■■■■□ 3
DNMT1P26358 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC33.82■■■■□ 3
DNMT1P26358 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC33.82■■■■□ 3
DNMT1P26358 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
DNMT1P26358 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
DNMT1P26358 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC33.81■■■■□ 3
DNMT1P26358 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC33.81■■■■□ 3
DNMT1P26358 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
DNMT1P26358 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.81■■■■□ 3
DNMT1P26358 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
DNMT1P26358 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
DNMT1P26358 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC33.8■■■■□ 3
DNMT1P26358 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
DNMT1P26358 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC33.8■■■■□ 3
DNMT1P26358 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
DNMT1P26358 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC33.8■■■■□ 3
DNMT1P26358 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC33.8■■■■□ 3
DNMT1P26358 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
DNMT1P26358 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC33.79■■■■□ 3
DNMT1P26358 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
DNMT1P26358 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC33.79■■■■□ 3
DNMT1P26358 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC33.79■■■■□ 3
DNMT1P26358 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC33.79■■■■□ 3
DNMT1P26358 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC33.79■■■■□ 3
DNMT1P26358 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
DNMT1P26358 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC33.79■■■■□ 3
DNMT1P26358 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC33.79■■■■□ 3
DNMT1P26358 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC33.79■■■■□ 3
DNMT1P26358 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
DNMT1P26358 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.78■■■■□ 3
DNMT1P26358 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.78■■■■□ 3
DNMT1P26358 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
DNMT1P26358 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
DNMT1P26358 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
DNMT1P26358 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
DNMT1P26358 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC33.78■■■■□ 3
DNMT1P26358 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
DNMT1P26358 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.77■■■■□ 3
DNMT1P26358 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
DNMT1P26358 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC33.77■■■■□ 3
DNMT1P26358 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
DNMT1P26358 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.77■■■■□ 3
DNMT1P26358 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
DNMT1P26358 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
DNMT1P26358 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC33.77■■■■□ 3
DNMT1P26358 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC33.76■■■■□ 3
DNMT1P26358 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC33.76■■■■□ 3
DNMT1P26358 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC33.76■■■■□ 3
DNMT1P26358 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC33.76■■■■□ 3
DNMT1P26358 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC33.76■■■■□ 3
DNMT1P26358 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC33.76■■■■□ 3
DNMT1P26358 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■■□ 3
DNMT1P26358 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
DNMT1P26358 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC33.76■■■□□ 2.99
DNMT1P26358 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.76■■■□□ 2.99
DNMT1P26358 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
DNMT1P26358 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC33.75■■■□□ 2.99
DNMT1P26358 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC33.75■■■□□ 2.99
DNMT1P26358 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC33.75■■■□□ 2.99
DNMT1P26358 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC33.75■■■□□ 2.99
DNMT1P26358 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
DNMT1P26358 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
DNMT1P26358 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
DNMT1P26358 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC33.75■■■□□ 2.99
DNMT1P26358 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC33.75■■■□□ 2.99
DNMT1P26358 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
DNMT1P26358 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
DNMT1P26358 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC33.75■■■□□ 2.99
DNMT1P26358 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
DNMT1P26358 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
DNMT1P26358 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC33.74■■■□□ 2.99
DNMT1P26358 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
DNMT1P26358 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
DNMT1P26358 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC33.73■■■□□ 2.99
DNMT1P26358 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.73■■■□□ 2.99
DNMT1P26358 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.73■■■□□ 2.99
DNMT1P26358 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
DNMT1P26358 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC33.73■■■□□ 2.99
DNMT1P26358 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
DNMT1P26358 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC33.73■■■□□ 2.99
DNMT1P26358 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC33.73■■■□□ 2.99
DNMT1P26358 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
DNMT1P26358 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC33.73■■■□□ 2.99
DNMT1P26358 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.73■■■□□ 2.99
DNMT1P26358 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
DNMT1P26358 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC33.73■■■□□ 2.99
DNMT1P26358 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC33.73■■■□□ 2.99
DNMT1P26358 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC33.72■■■□□ 2.99
DNMT1P26358 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.72■■■□□ 2.99
DNMT1P26358 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC33.72■■■□□ 2.99
DNMT1P26358 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC33.72■■■□□ 2.99
DNMT1P26358 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC33.72■■■□□ 2.99
DNMT1P26358 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC33.72■■■□□ 2.99
DNMT1P26358 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC33.72■■■□□ 2.99
DNMT1P26358 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC33.72■■■□□ 2.99
DNMT1P26358 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC33.72■■■□□ 2.99
DNMT1P26358 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC33.72■■■□□ 2.99
DNMT1P26358 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.2 ms