Protein–RNA interactions for Protein: P26022

PTX3, Pentraxin-related protein PTX3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTX3P26022 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
PTX3P26022 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PTX3P26022 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PTX3P26022 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PTX3P26022 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PTX3P26022 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PTX3P26022 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PTX3P26022 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PTX3P26022 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PTX3P26022 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PTX3P26022 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PTX3P26022 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PTX3P26022 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PTX3P26022 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PTX3P26022 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PTX3P26022 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
PTX3P26022 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PTX3P26022 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PTX3P26022 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PTX3P26022 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PTX3P26022 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PTX3P26022 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PTX3P26022 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PTX3P26022 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PTX3P26022 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PTX3P26022 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PTX3P26022 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PTX3P26022 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PTX3P26022 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PTX3P26022 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PTX3P26022 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PTX3P26022 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PTX3P26022 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PTX3P26022 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PTX3P26022 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PTX3P26022 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PTX3P26022 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PTX3P26022 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PTX3P26022 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PTX3P26022 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PTX3P26022 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PTX3P26022 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PTX3P26022 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PTX3P26022 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PTX3P26022 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PTX3P26022 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PTX3P26022 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PTX3P26022 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PTX3P26022 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PTX3P26022 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PTX3P26022 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PTX3P26022 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PTX3P26022 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PTX3P26022 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PTX3P26022 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PTX3P26022 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PTX3P26022 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PTX3P26022 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PTX3P26022 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PTX3P26022 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PTX3P26022 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PTX3P26022 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PTX3P26022 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PTX3P26022 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
PTX3P26022 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
PTX3P26022 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
PTX3P26022 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PTX3P26022 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PTX3P26022 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
PTX3P26022 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
PTX3P26022 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PTX3P26022 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
PTX3P26022 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC21.32■■□□□ 1
PTX3P26022 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
PTX3P26022 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
PTX3P26022 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
PTX3P26022 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PTX3P26022 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PTX3P26022 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PTX3P26022 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC21.31■■□□□ 1
PTX3P26022 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC21.31■■□□□ 1
PTX3P26022 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC21.31■■□□□ 1
PTX3P26022 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PTX3P26022 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
PTX3P26022 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
PTX3P26022 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PTX3P26022 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC21.3■■□□□ 1
PTX3P26022 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
PTX3P26022 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
PTX3P26022 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PTX3P26022 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
PTX3P26022 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
PTX3P26022 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
PTX3P26022 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
PTX3P26022 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PTX3P26022 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PTX3P26022 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PTX3P26022 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PTX3P26022 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
PTX3P26022 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms