Protein–RNA interactions for Protein: P25391

LAMA1, Laminin subunit alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 3,075 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMA1P25391 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LAMA1P25391 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LAMA1P25391 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LAMA1P25391 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
LAMA1P25391 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LAMA1P25391 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LAMA1P25391 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LAMA1P25391 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LAMA1P25391 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LAMA1P25391 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LAMA1P25391 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
LAMA1P25391 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
LAMA1P25391 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
LAMA1P25391 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
LAMA1P25391 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
LAMA1P25391 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
LAMA1P25391 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
LAMA1P25391 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
LAMA1P25391 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
LAMA1P25391 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
LAMA1P25391 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
LAMA1P25391 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
LAMA1P25391 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
LAMA1P25391 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
LAMA1P25391 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
LAMA1P25391 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
LAMA1P25391 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.12
LAMA1P25391 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LAMA1P25391 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LAMA1P25391 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LAMA1P25391 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LAMA1P25391 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LAMA1P25391 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LAMA1P25391 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LAMA1P25391 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LAMA1P25391 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LAMA1P25391 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
LAMA1P25391 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
LAMA1P25391 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LAMA1P25391 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LAMA1P25391 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LAMA1P25391 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
LAMA1P25391 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LAMA1P25391 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LAMA1P25391 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LAMA1P25391 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LAMA1P25391 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
LAMA1P25391 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LAMA1P25391 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LAMA1P25391 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
LAMA1P25391 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
LAMA1P25391 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
LAMA1P25391 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
LAMA1P25391 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LAMA1P25391 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LAMA1P25391 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
LAMA1P25391 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LAMA1P25391 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LAMA1P25391 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
LAMA1P25391 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LAMA1P25391 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LAMA1P25391 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LAMA1P25391 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LAMA1P25391 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LAMA1P25391 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LAMA1P25391 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LAMA1P25391 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LAMA1P25391 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LAMA1P25391 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LAMA1P25391 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LAMA1P25391 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
LAMA1P25391 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LAMA1P25391 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LAMA1P25391 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LAMA1P25391 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LAMA1P25391 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LAMA1P25391 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LAMA1P25391 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LAMA1P25391 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LAMA1P25391 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LAMA1P25391 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LAMA1P25391 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LAMA1P25391 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LAMA1P25391 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LAMA1P25391 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LAMA1P25391 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LAMA1P25391 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LAMA1P25391 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LAMA1P25391 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LAMA1P25391 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LAMA1P25391 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LAMA1P25391 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LAMA1P25391 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LAMA1P25391 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LAMA1P25391 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
LAMA1P25391 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LAMA1P25391 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LAMA1P25391 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
LAMA1P25391 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
LAMA1P25391 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms