Protein–RNA interactions for Protein: P24390

KDELR1, ER lumen protein-retaining receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDELR1P24390 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
KDELR1P24390 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
KDELR1P24390 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
KDELR1P24390 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
KDELR1P24390 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
KDELR1P24390 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
KDELR1P24390 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
KDELR1P24390 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
KDELR1P24390 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
KDELR1P24390 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
KDELR1P24390 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
KDELR1P24390 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
KDELR1P24390 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
KDELR1P24390 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
KDELR1P24390 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
KDELR1P24390 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
KDELR1P24390 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
KDELR1P24390 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
KDELR1P24390 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
KDELR1P24390 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
KDELR1P24390 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
KDELR1P24390 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
KDELR1P24390 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
KDELR1P24390 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
KDELR1P24390 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
KDELR1P24390 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
KDELR1P24390 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
KDELR1P24390 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
KDELR1P24390 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
KDELR1P24390 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
KDELR1P24390 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
KDELR1P24390 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
KDELR1P24390 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
KDELR1P24390 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
KDELR1P24390 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
KDELR1P24390 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
KDELR1P24390 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
KDELR1P24390 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
KDELR1P24390 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
KDELR1P24390 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
KDELR1P24390 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
KDELR1P24390 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
KDELR1P24390 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
KDELR1P24390 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
KDELR1P24390 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
KDELR1P24390 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
KDELR1P24390 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
KDELR1P24390 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
KDELR1P24390 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
KDELR1P24390 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
KDELR1P24390 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
KDELR1P24390 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
KDELR1P24390 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
KDELR1P24390 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
KDELR1P24390 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
KDELR1P24390 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
KDELR1P24390 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
KDELR1P24390 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
KDELR1P24390 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
KDELR1P24390 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
KDELR1P24390 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
KDELR1P24390 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
KDELR1P24390 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
KDELR1P24390 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
KDELR1P24390 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
KDELR1P24390 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
KDELR1P24390 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
KDELR1P24390 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
KDELR1P24390 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
KDELR1P24390 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
KDELR1P24390 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC23.1■■□□□ 1.29
KDELR1P24390 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
KDELR1P24390 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
KDELR1P24390 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
KDELR1P24390 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
KDELR1P24390 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
KDELR1P24390 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
KDELR1P24390 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
KDELR1P24390 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
KDELR1P24390 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
KDELR1P24390 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
KDELR1P24390 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
KDELR1P24390 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
KDELR1P24390 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
KDELR1P24390 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
KDELR1P24390 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
KDELR1P24390 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
KDELR1P24390 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
KDELR1P24390 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
KDELR1P24390 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
KDELR1P24390 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
KDELR1P24390 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
KDELR1P24390 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
KDELR1P24390 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
KDELR1P24390 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
KDELR1P24390 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
KDELR1P24390 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
KDELR1P24390 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
KDELR1P24390 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
KDELR1P24390 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.6 ms