Protein–RNA interactions for Protein: P23634

ATP2B4, Plasma membrane calcium-transporting ATPase 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP2B4P23634 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
ATP2B4P23634 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
ATP2B4P23634 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
ATP2B4P23634 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
ATP2B4P23634 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
ATP2B4P23634 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
ATP2B4P23634 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
ATP2B4P23634 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
ATP2B4P23634 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
ATP2B4P23634 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
ATP2B4P23634 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
ATP2B4P23634 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
ATP2B4P23634 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
ATP2B4P23634 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
ATP2B4P23634 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
ATP2B4P23634 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
ATP2B4P23634 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
ATP2B4P23634 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
ATP2B4P23634 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
ATP2B4P23634 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
ATP2B4P23634 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
ATP2B4P23634 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
ATP2B4P23634 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
ATP2B4P23634 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
ATP2B4P23634 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
ATP2B4P23634 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC27.36■■□□□ 1.97
ATP2B4P23634 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
ATP2B4P23634 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
ATP2B4P23634 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
ATP2B4P23634 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
ATP2B4P23634 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
ATP2B4P23634 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
ATP2B4P23634 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
ATP2B4P23634 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
ATP2B4P23634 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC27.35■■□□□ 1.97
ATP2B4P23634 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
ATP2B4P23634 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
ATP2B4P23634 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
ATP2B4P23634 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
ATP2B4P23634 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
ATP2B4P23634 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
ATP2B4P23634 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
ATP2B4P23634 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
ATP2B4P23634 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
ATP2B4P23634 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
ATP2B4P23634 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC27.34■■□□□ 1.97
ATP2B4P23634 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
ATP2B4P23634 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
ATP2B4P23634 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
ATP2B4P23634 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
ATP2B4P23634 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
ATP2B4P23634 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
ATP2B4P23634 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
ATP2B4P23634 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
ATP2B4P23634 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
ATP2B4P23634 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
ATP2B4P23634 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
ATP2B4P23634 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
ATP2B4P23634 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
ATP2B4P23634 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
ATP2B4P23634 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
ATP2B4P23634 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.96
ATP2B4P23634 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
ATP2B4P23634 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
ATP2B4P23634 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC27.32■■□□□ 1.96
ATP2B4P23634 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
ATP2B4P23634 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
ATP2B4P23634 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
ATP2B4P23634 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
ATP2B4P23634 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
ATP2B4P23634 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
ATP2B4P23634 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
ATP2B4P23634 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
ATP2B4P23634 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
ATP2B4P23634 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
ATP2B4P23634 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
ATP2B4P23634 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
ATP2B4P23634 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
ATP2B4P23634 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
ATP2B4P23634 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
ATP2B4P23634 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
ATP2B4P23634 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
ATP2B4P23634 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
ATP2B4P23634 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
ATP2B4P23634 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
ATP2B4P23634 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
ATP2B4P23634 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
ATP2B4P23634 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
ATP2B4P23634 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
ATP2B4P23634 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
ATP2B4P23634 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
ATP2B4P23634 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
ATP2B4P23634 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
ATP2B4P23634 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
ATP2B4P23634 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
ATP2B4P23634 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
ATP2B4P23634 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
ATP2B4P23634 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
ATP2B4P23634 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
ATP2B4P23634 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.9 ms