Protein–RNA interactions for Protein: P22307

SCP2, Non-specific lipid-transfer protein, humanhuman

Predictions only

Length 547 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCP2P22307 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SCP2P22307 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SCP2P22307 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SCP2P22307 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SCP2P22307 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SCP2P22307 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SCP2P22307 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SCP2P22307 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SCP2P22307 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SCP2P22307 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SCP2P22307 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SCP2P22307 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SCP2P22307 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SCP2P22307 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SCP2P22307 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SCP2P22307 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SCP2P22307 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SCP2P22307 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SCP2P22307 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SCP2P22307 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SCP2P22307 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SCP2P22307 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SCP2P22307 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
SCP2P22307 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SCP2P22307 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SCP2P22307 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SCP2P22307 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SCP2P22307 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SCP2P22307 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SCP2P22307 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SCP2P22307 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
SCP2P22307 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SCP2P22307 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SCP2P22307 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SCP2P22307 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SCP2P22307 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SCP2P22307 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SCP2P22307 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SCP2P22307 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SCP2P22307 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SCP2P22307 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SCP2P22307 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SCP2P22307 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
SCP2P22307 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SCP2P22307 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SCP2P22307 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SCP2P22307 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SCP2P22307 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SCP2P22307 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SCP2P22307 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
SCP2P22307 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SCP2P22307 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SCP2P22307 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SCP2P22307 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SCP2P22307 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SCP2P22307 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SCP2P22307 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
SCP2P22307 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SCP2P22307 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SCP2P22307 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SCP2P22307 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SCP2P22307 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SCP2P22307 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SCP2P22307 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SCP2P22307 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SCP2P22307 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SCP2P22307 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SCP2P22307 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SCP2P22307 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SCP2P22307 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SCP2P22307 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
SCP2P22307 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SCP2P22307 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SCP2P22307 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SCP2P22307 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SCP2P22307 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SCP2P22307 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SCP2P22307 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SCP2P22307 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
SCP2P22307 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
SCP2P22307 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SCP2P22307 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
SCP2P22307 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SCP2P22307 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SCP2P22307 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SCP2P22307 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SCP2P22307 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SCP2P22307 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SCP2P22307 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SCP2P22307 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
SCP2P22307 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
SCP2P22307 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
SCP2P22307 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SCP2P22307 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
SCP2P22307 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SCP2P22307 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SCP2P22307 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SCP2P22307 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SCP2P22307 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SCP2P22307 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.5 ms