Protein–RNA interactions for Protein: P20807

CAPN3, Calpain-3, humanhuman

Predictions only

Length 821 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPN3P20807 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CAPN3P20807 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CAPN3P20807 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CAPN3P20807 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CAPN3P20807 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
CAPN3P20807 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CAPN3P20807 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CAPN3P20807 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CAPN3P20807 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CAPN3P20807 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CAPN3P20807 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CAPN3P20807 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CAPN3P20807 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CAPN3P20807 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
CAPN3P20807 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CAPN3P20807 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CAPN3P20807 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CAPN3P20807 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CAPN3P20807 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CAPN3P20807 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CAPN3P20807 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CAPN3P20807 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CAPN3P20807 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CAPN3P20807 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CAPN3P20807 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CAPN3P20807 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CAPN3P20807 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CAPN3P20807 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CAPN3P20807 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CAPN3P20807 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CAPN3P20807 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CAPN3P20807 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CAPN3P20807 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CAPN3P20807 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CAPN3P20807 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CAPN3P20807 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
CAPN3P20807 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CAPN3P20807 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CAPN3P20807 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CAPN3P20807 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CAPN3P20807 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CAPN3P20807 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CAPN3P20807 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CAPN3P20807 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CAPN3P20807 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CAPN3P20807 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CAPN3P20807 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CAPN3P20807 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CAPN3P20807 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CAPN3P20807 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CAPN3P20807 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CAPN3P20807 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CAPN3P20807 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CAPN3P20807 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
CAPN3P20807 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CAPN3P20807 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CAPN3P20807 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CAPN3P20807 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CAPN3P20807 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CAPN3P20807 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CAPN3P20807 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CAPN3P20807 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CAPN3P20807 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CAPN3P20807 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CAPN3P20807 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CAPN3P20807 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CAPN3P20807 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CAPN3P20807 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CAPN3P20807 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CAPN3P20807 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CAPN3P20807 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CAPN3P20807 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CAPN3P20807 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CAPN3P20807 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CAPN3P20807 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CAPN3P20807 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CAPN3P20807 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CAPN3P20807 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CAPN3P20807 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CAPN3P20807 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CAPN3P20807 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
CAPN3P20807 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CAPN3P20807 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CAPN3P20807 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CAPN3P20807 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CAPN3P20807 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CAPN3P20807 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
CAPN3P20807 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CAPN3P20807 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CAPN3P20807 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CAPN3P20807 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CAPN3P20807 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CAPN3P20807 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CAPN3P20807 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CAPN3P20807 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CAPN3P20807 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CAPN3P20807 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
CAPN3P20807 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CAPN3P20807 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CAPN3P20807 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms