Protein–RNA interactions for Protein: P20648

ATP4A, Potassium-transporting ATPase alpha chain 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,035 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP4AP20648 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ATP4AP20648 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ATP4AP20648 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
ATP4AP20648 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
ATP4AP20648 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ATP4AP20648 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ATP4AP20648 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ATP4AP20648 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
ATP4AP20648 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ATP4AP20648 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ATP4AP20648 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
ATP4AP20648 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ATP4AP20648 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
ATP4AP20648 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
ATP4AP20648 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
ATP4AP20648 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
ATP4AP20648 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ATP4AP20648 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ATP4AP20648 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
ATP4AP20648 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
ATP4AP20648 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ATP4AP20648 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
ATP4AP20648 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
ATP4AP20648 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
ATP4AP20648 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ATP4AP20648 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ATP4AP20648 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
ATP4AP20648 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
ATP4AP20648 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
ATP4AP20648 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
ATP4AP20648 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
ATP4AP20648 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
ATP4AP20648 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
ATP4AP20648 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
ATP4AP20648 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
ATP4AP20648 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.58
ATP4AP20648 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
ATP4AP20648 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
ATP4AP20648 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
ATP4AP20648 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ATP4AP20648 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ATP4AP20648 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
ATP4AP20648 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ATP4AP20648 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
ATP4AP20648 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
ATP4AP20648 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ATP4AP20648 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ATP4AP20648 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
ATP4AP20648 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
ATP4AP20648 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ATP4AP20648 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ATP4AP20648 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ATP4AP20648 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ATP4AP20648 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
ATP4AP20648 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ATP4AP20648 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
ATP4AP20648 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ATP4AP20648 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ATP4AP20648 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ATP4AP20648 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ATP4AP20648 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ATP4AP20648 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ATP4AP20648 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ATP4AP20648 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ATP4AP20648 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ATP4AP20648 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ATP4AP20648 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ATP4AP20648 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ATP4AP20648 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
ATP4AP20648 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
ATP4AP20648 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ATP4AP20648 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
ATP4AP20648 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
ATP4AP20648 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ATP4AP20648 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ATP4AP20648 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ATP4AP20648 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ATP4AP20648 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ATP4AP20648 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ATP4AP20648 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ATP4AP20648 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ATP4AP20648 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ATP4AP20648 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
ATP4AP20648 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
ATP4AP20648 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ATP4AP20648 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
ATP4AP20648 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
ATP4AP20648 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
ATP4AP20648 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ATP4AP20648 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ATP4AP20648 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
ATP4AP20648 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ATP4AP20648 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ATP4AP20648 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ATP4AP20648 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ATP4AP20648 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
ATP4AP20648 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
ATP4AP20648 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
ATP4AP20648 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ATP4AP20648 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.7 ms