Protein–RNA interactions for Protein: P19876

CXCL3, C-X-C motif chemokine 3, humanhuman

Predictions only

Length 107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL3P19876 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CXCL3P19876 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CXCL3P19876 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CXCL3P19876 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CXCL3P19876 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CXCL3P19876 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CXCL3P19876 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CXCL3P19876 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CXCL3P19876 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CXCL3P19876 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CXCL3P19876 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CXCL3P19876 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CXCL3P19876 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CXCL3P19876 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CXCL3P19876 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CXCL3P19876 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CXCL3P19876 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CXCL3P19876 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CXCL3P19876 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CXCL3P19876 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CXCL3P19876 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
CXCL3P19876 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CXCL3P19876 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CXCL3P19876 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CXCL3P19876 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CXCL3P19876 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CXCL3P19876 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CXCL3P19876 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CXCL3P19876 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CXCL3P19876 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CXCL3P19876 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CXCL3P19876 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CXCL3P19876 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CXCL3P19876 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CXCL3P19876 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CXCL3P19876 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CXCL3P19876 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CXCL3P19876 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CXCL3P19876 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CXCL3P19876 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CXCL3P19876 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
CXCL3P19876 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
CXCL3P19876 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CXCL3P19876 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CXCL3P19876 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
CXCL3P19876 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CXCL3P19876 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CXCL3P19876 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CXCL3P19876 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CXCL3P19876 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CXCL3P19876 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CXCL3P19876 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CXCL3P19876 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CXCL3P19876 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CXCL3P19876 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CXCL3P19876 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CXCL3P19876 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CXCL3P19876 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CXCL3P19876 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CXCL3P19876 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CXCL3P19876 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CXCL3P19876 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CXCL3P19876 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CXCL3P19876 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CXCL3P19876 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CXCL3P19876 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CXCL3P19876 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CXCL3P19876 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CXCL3P19876 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CXCL3P19876 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
CXCL3P19876 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CXCL3P19876 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CXCL3P19876 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CXCL3P19876 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CXCL3P19876 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CXCL3P19876 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CXCL3P19876 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CXCL3P19876 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CXCL3P19876 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CXCL3P19876 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CXCL3P19876 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CXCL3P19876 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CXCL3P19876 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CXCL3P19876 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CXCL3P19876 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CXCL3P19876 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CXCL3P19876 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CXCL3P19876 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CXCL3P19876 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CXCL3P19876 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CXCL3P19876 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CXCL3P19876 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CXCL3P19876 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CXCL3P19876 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CXCL3P19876 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CXCL3P19876 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CXCL3P19876 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CXCL3P19876 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CXCL3P19876 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CXCL3P19876 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms