Protein–RNA interactions for Protein: P19012

KRT15, Keratin, type I cytoskeletal 15, humanhuman

Predictions only

Length 456 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT15P19012 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
KRT15P19012 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
KRT15P19012 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
KRT15P19012 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
KRT15P19012 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
KRT15P19012 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
KRT15P19012 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
KRT15P19012 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
KRT15P19012 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
KRT15P19012 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
KRT15P19012 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
KRT15P19012 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
KRT15P19012 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
KRT15P19012 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
KRT15P19012 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
KRT15P19012 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
KRT15P19012 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
KRT15P19012 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
KRT15P19012 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
KRT15P19012 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
KRT15P19012 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
KRT15P19012 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
KRT15P19012 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
KRT15P19012 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
KRT15P19012 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
KRT15P19012 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
KRT15P19012 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
KRT15P19012 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
KRT15P19012 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
KRT15P19012 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
KRT15P19012 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
KRT15P19012 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
KRT15P19012 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
KRT15P19012 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
KRT15P19012 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
KRT15P19012 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
KRT15P19012 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
KRT15P19012 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
KRT15P19012 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
KRT15P19012 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
KRT15P19012 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
KRT15P19012 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
KRT15P19012 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
KRT15P19012 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
KRT15P19012 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
KRT15P19012 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
KRT15P19012 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
KRT15P19012 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
KRT15P19012 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
KRT15P19012 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
KRT15P19012 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
KRT15P19012 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
KRT15P19012 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
KRT15P19012 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
KRT15P19012 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
KRT15P19012 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
KRT15P19012 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
KRT15P19012 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
KRT15P19012 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
KRT15P19012 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
KRT15P19012 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
KRT15P19012 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
KRT15P19012 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
KRT15P19012 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
KRT15P19012 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
KRT15P19012 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
KRT15P19012 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
KRT15P19012 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
KRT15P19012 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
KRT15P19012 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
KRT15P19012 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
KRT15P19012 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
KRT15P19012 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
KRT15P19012 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
KRT15P19012 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
KRT15P19012 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
KRT15P19012 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
KRT15P19012 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
KRT15P19012 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
KRT15P19012 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
KRT15P19012 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
KRT15P19012 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
KRT15P19012 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
KRT15P19012 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
KRT15P19012 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
KRT15P19012 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
KRT15P19012 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
KRT15P19012 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
KRT15P19012 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
KRT15P19012 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
KRT15P19012 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
KRT15P19012 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
KRT15P19012 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
KRT15P19012 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
KRT15P19012 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
KRT15P19012 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
KRT15P19012 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
KRT15P19012 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
KRT15P19012 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
KRT15P19012 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms