Protein–RNA interactions for Protein: P18564

ITGB6, Integrin beta-6, humanhuman

Predictions only

Length 788 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB6P18564 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ITGB6P18564 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ITGB6P18564 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ITGB6P18564 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ITGB6P18564 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ITGB6P18564 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ITGB6P18564 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ITGB6P18564 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ITGB6P18564 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ITGB6P18564 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ITGB6P18564 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ITGB6P18564 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ITGB6P18564 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ITGB6P18564 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
ITGB6P18564 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ITGB6P18564 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ITGB6P18564 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ITGB6P18564 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ITGB6P18564 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ITGB6P18564 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ITGB6P18564 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ITGB6P18564 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ITGB6P18564 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
ITGB6P18564 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ITGB6P18564 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ITGB6P18564 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
ITGB6P18564 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ITGB6P18564 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
ITGB6P18564 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ITGB6P18564 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ITGB6P18564 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ITGB6P18564 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ITGB6P18564 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ITGB6P18564 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ITGB6P18564 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ITGB6P18564 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ITGB6P18564 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ITGB6P18564 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ITGB6P18564 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ITGB6P18564 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ITGB6P18564 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ITGB6P18564 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ITGB6P18564 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ITGB6P18564 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ITGB6P18564 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ITGB6P18564 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ITGB6P18564 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ITGB6P18564 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ITGB6P18564 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
ITGB6P18564 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
ITGB6P18564 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
ITGB6P18564 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
ITGB6P18564 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ITGB6P18564 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
ITGB6P18564 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ITGB6P18564 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ITGB6P18564 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ITGB6P18564 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ITGB6P18564 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ITGB6P18564 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ITGB6P18564 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ITGB6P18564 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ITGB6P18564 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ITGB6P18564 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ITGB6P18564 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ITGB6P18564 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
ITGB6P18564 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ITGB6P18564 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ITGB6P18564 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ITGB6P18564 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ITGB6P18564 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ITGB6P18564 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ITGB6P18564 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ITGB6P18564 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ITGB6P18564 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ITGB6P18564 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ITGB6P18564 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
ITGB6P18564 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ITGB6P18564 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ITGB6P18564 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ITGB6P18564 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ITGB6P18564 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ITGB6P18564 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ITGB6P18564 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
ITGB6P18564 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ITGB6P18564 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ITGB6P18564 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ITGB6P18564 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ITGB6P18564 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ITGB6P18564 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ITGB6P18564 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ITGB6P18564 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ITGB6P18564 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ITGB6P18564 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ITGB6P18564 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
ITGB6P18564 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
ITGB6P18564 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ITGB6P18564 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ITGB6P18564 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ITGB6P18564 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms