Protein–RNA interactions for Protein: P17482

HOXB9, Homeobox protein Hox-B9, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB9P17482 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
HOXB9P17482 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
HOXB9P17482 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
HOXB9P17482 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
HOXB9P17482 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
HOXB9P17482 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
HOXB9P17482 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
HOXB9P17482 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
HOXB9P17482 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
HOXB9P17482 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
HOXB9P17482 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
HOXB9P17482 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
HOXB9P17482 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
HOXB9P17482 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
HOXB9P17482 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
HOXB9P17482 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
HOXB9P17482 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
HOXB9P17482 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
HOXB9P17482 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
HOXB9P17482 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
HOXB9P17482 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
HOXB9P17482 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
HOXB9P17482 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
HOXB9P17482 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
HOXB9P17482 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
HOXB9P17482 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
HOXB9P17482 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
HOXB9P17482 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
HOXB9P17482 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
HOXB9P17482 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
HOXB9P17482 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
HOXB9P17482 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
HOXB9P17482 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
HOXB9P17482 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
HOXB9P17482 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
HOXB9P17482 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
HOXB9P17482 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
HOXB9P17482 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
HOXB9P17482 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
HOXB9P17482 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
HOXB9P17482 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
HOXB9P17482 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
HOXB9P17482 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
HOXB9P17482 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
HOXB9P17482 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
HOXB9P17482 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
HOXB9P17482 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
HOXB9P17482 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.96
HOXB9P17482 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
HOXB9P17482 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
HOXB9P17482 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
HOXB9P17482 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
HOXB9P17482 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
HOXB9P17482 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
HOXB9P17482 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
HOXB9P17482 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
HOXB9P17482 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
HOXB9P17482 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
HOXB9P17482 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
HOXB9P17482 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
HOXB9P17482 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
HOXB9P17482 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
HOXB9P17482 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
HOXB9P17482 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
HOXB9P17482 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
HOXB9P17482 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
HOXB9P17482 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
HOXB9P17482 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
HOXB9P17482 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
HOXB9P17482 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
HOXB9P17482 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
HOXB9P17482 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
HOXB9P17482 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
HOXB9P17482 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
HOXB9P17482 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
HOXB9P17482 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
HOXB9P17482 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC21■□□□□ 0.95
HOXB9P17482 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
HOXB9P17482 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
HOXB9P17482 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
HOXB9P17482 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
HOXB9P17482 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
HOXB9P17482 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
HOXB9P17482 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
HOXB9P17482 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
HOXB9P17482 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
HOXB9P17482 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
HOXB9P17482 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
HOXB9P17482 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
HOXB9P17482 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
HOXB9P17482 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
HOXB9P17482 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
HOXB9P17482 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC20.99■□□□□ 0.95
HOXB9P17482 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
HOXB9P17482 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
HOXB9P17482 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
HOXB9P17482 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
HOXB9P17482 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
HOXB9P17482 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
HOXB9P17482 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms