Protein–RNA interactions for Protein: P17040

ZSCAN20, Zinc finger and SCAN domain-containing protein 20, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,043 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZSCAN20P17040 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ZSCAN20P17040 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
ZSCAN20P17040 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ZSCAN20P17040 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ZSCAN20P17040 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
ZSCAN20P17040 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
ZSCAN20P17040 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
ZSCAN20P17040 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ZSCAN20P17040 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
ZSCAN20P17040 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
ZSCAN20P17040 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
ZSCAN20P17040 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
ZSCAN20P17040 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
ZSCAN20P17040 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
ZSCAN20P17040 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
ZSCAN20P17040 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
ZSCAN20P17040 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ZSCAN20P17040 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ZSCAN20P17040 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
ZSCAN20P17040 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ZSCAN20P17040 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ZSCAN20P17040 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ZSCAN20P17040 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
ZSCAN20P17040 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
ZSCAN20P17040 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ZSCAN20P17040 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ZSCAN20P17040 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ZSCAN20P17040 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ZSCAN20P17040 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ZSCAN20P17040 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ZSCAN20P17040 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
ZSCAN20P17040 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ZSCAN20P17040 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ZSCAN20P17040 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
ZSCAN20P17040 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ZSCAN20P17040 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
ZSCAN20P17040 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
ZSCAN20P17040 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ZSCAN20P17040 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
ZSCAN20P17040 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
ZSCAN20P17040 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
ZSCAN20P17040 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
ZSCAN20P17040 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
ZSCAN20P17040 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
ZSCAN20P17040 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
ZSCAN20P17040 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
ZSCAN20P17040 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
ZSCAN20P17040 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
ZSCAN20P17040 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
ZSCAN20P17040 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ZSCAN20P17040 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ZSCAN20P17040 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
ZSCAN20P17040 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ZSCAN20P17040 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ZSCAN20P17040 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ZSCAN20P17040 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ZSCAN20P17040 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
ZSCAN20P17040 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ZSCAN20P17040 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
ZSCAN20P17040 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ZSCAN20P17040 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ZSCAN20P17040 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
ZSCAN20P17040 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
ZSCAN20P17040 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
ZSCAN20P17040 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC25.06■■□□□ 1.6
ZSCAN20P17040 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ZSCAN20P17040 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
ZSCAN20P17040 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ZSCAN20P17040 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ZSCAN20P17040 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ZSCAN20P17040 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ZSCAN20P17040 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
ZSCAN20P17040 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC25.05■■□□□ 1.6
ZSCAN20P17040 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
ZSCAN20P17040 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ZSCAN20P17040 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ZSCAN20P17040 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
ZSCAN20P17040 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
ZSCAN20P17040 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ZSCAN20P17040 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
ZSCAN20P17040 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ZSCAN20P17040 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ZSCAN20P17040 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ZSCAN20P17040 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ZSCAN20P17040 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ZSCAN20P17040 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ZSCAN20P17040 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
ZSCAN20P17040 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
ZSCAN20P17040 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
ZSCAN20P17040 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ZSCAN20P17040 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
ZSCAN20P17040 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
ZSCAN20P17040 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
ZSCAN20P17040 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ZSCAN20P17040 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ZSCAN20P17040 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ZSCAN20P17040 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ZSCAN20P17040 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC25.02■■□□□ 1.6
ZSCAN20P17040 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ZSCAN20P17040 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms