Protein–RNA interactions for Protein: P16519

PCSK2, Neuroendocrine convertase 2, humanhuman

Predictions only

Length 638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCSK2P16519 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
PCSK2P16519 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC21.33■■□□□ 1
PCSK2P16519 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
PCSK2P16519 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
PCSK2P16519 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PCSK2P16519 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
PCSK2P16519 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PCSK2P16519 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PCSK2P16519 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PCSK2P16519 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PCSK2P16519 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
PCSK2P16519 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
PCSK2P16519 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC21.32■■□□□ 1
PCSK2P16519 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PCSK2P16519 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
PCSK2P16519 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PCSK2P16519 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
PCSK2P16519 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
PCSK2P16519 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PCSK2P16519 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
PCSK2P16519 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PCSK2P16519 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
PCSK2P16519 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
PCSK2P16519 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PCSK2P16519 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PCSK2P16519 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC21.31■■□□□ 1
PCSK2P16519 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
PCSK2P16519 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PCSK2P16519 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PCSK2P16519 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PCSK2P16519 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
PCSK2P16519 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
PCSK2P16519 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PCSK2P16519 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
PCSK2P16519 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
PCSK2P16519 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PCSK2P16519 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PCSK2P16519 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PCSK2P16519 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
PCSK2P16519 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
PCSK2P16519 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
PCSK2P16519 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
PCSK2P16519 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC21.29■■□□□ 1
PCSK2P16519 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PCSK2P16519 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PCSK2P16519 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
PCSK2P16519 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PCSK2P16519 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
PCSK2P16519 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PCSK2P16519 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC21.29■■□□□ 1
PCSK2P16519 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
PCSK2P16519 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
PCSK2P16519 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PCSK2P16519 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PCSK2P16519 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PCSK2P16519 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PCSK2P16519 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PCSK2P16519 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PCSK2P16519 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PCSK2P16519 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PCSK2P16519 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
PCSK2P16519 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
PCSK2P16519 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PCSK2P16519 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PCSK2P16519 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PCSK2P16519 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
PCSK2P16519 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PCSK2P16519 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PCSK2P16519 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PCSK2P16519 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
PCSK2P16519 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PCSK2P16519 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
PCSK2P16519 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
PCSK2P16519 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
PCSK2P16519 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
PCSK2P16519 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
PCSK2P16519 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PCSK2P16519 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PCSK2P16519 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
PCSK2P16519 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
PCSK2P16519 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
PCSK2P16519 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC21.27■□□□□ 0.99
PCSK2P16519 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
PCSK2P16519 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PCSK2P16519 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PCSK2P16519 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PCSK2P16519 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PCSK2P16519 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PCSK2P16519 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PCSK2P16519 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PCSK2P16519 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
PCSK2P16519 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
PCSK2P16519 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PCSK2P16519 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PCSK2P16519 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PCSK2P16519 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PCSK2P16519 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PCSK2P16519 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PCSK2P16519 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PCSK2P16519 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.2 ms