Protein–RNA interactions for Protein: P15918

RAG1, V(D)J recombination-activating protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,043 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAG1P15918 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
RAG1P15918 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
RAG1P15918 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
RAG1P15918 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RAG1P15918 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
RAG1P15918 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
RAG1P15918 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
RAG1P15918 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RAG1P15918 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RAG1P15918 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
RAG1P15918 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RAG1P15918 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
RAG1P15918 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
RAG1P15918 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
RAG1P15918 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
RAG1P15918 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
RAG1P15918 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
RAG1P15918 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
RAG1P15918 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
RAG1P15918 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
RAG1P15918 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
RAG1P15918 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
RAG1P15918 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
RAG1P15918 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
RAG1P15918 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RAG1P15918 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RAG1P15918 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RAG1P15918 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RAG1P15918 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
RAG1P15918 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RAG1P15918 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RAG1P15918 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
RAG1P15918 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RAG1P15918 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
RAG1P15918 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RAG1P15918 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
RAG1P15918 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
RAG1P15918 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
RAG1P15918 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RAG1P15918 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RAG1P15918 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RAG1P15918 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
RAG1P15918 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
RAG1P15918 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
RAG1P15918 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
RAG1P15918 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
RAG1P15918 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
RAG1P15918 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
RAG1P15918 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
RAG1P15918 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
RAG1P15918 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
RAG1P15918 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC24.64■■□□□ 1.54
RAG1P15918 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
RAG1P15918 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
RAG1P15918 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
RAG1P15918 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
RAG1P15918 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
RAG1P15918 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
RAG1P15918 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
RAG1P15918 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
RAG1P15918 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RAG1P15918 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RAG1P15918 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RAG1P15918 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
RAG1P15918 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
RAG1P15918 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
RAG1P15918 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
RAG1P15918 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RAG1P15918 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
RAG1P15918 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RAG1P15918 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RAG1P15918 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RAG1P15918 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
RAG1P15918 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RAG1P15918 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
RAG1P15918 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
RAG1P15918 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
RAG1P15918 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
RAG1P15918 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
RAG1P15918 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RAG1P15918 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
RAG1P15918 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RAG1P15918 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
RAG1P15918 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC24.61■■□□□ 1.53
RAG1P15918 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC24.61■■□□□ 1.53
RAG1P15918 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
RAG1P15918 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
RAG1P15918 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
RAG1P15918 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RAG1P15918 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RAG1P15918 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
RAG1P15918 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
RAG1P15918 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
RAG1P15918 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
RAG1P15918 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
RAG1P15918 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
RAG1P15918 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RAG1P15918 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
RAG1P15918 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RAG1P15918 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms