Protein–RNA interactions for Protein: P15509

CSF2RA, Granulocyte-macrophage colony-stimulating factor receptor subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSF2RAP15509 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CSF2RAP15509 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CSF2RAP15509 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CSF2RAP15509 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CSF2RAP15509 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
CSF2RAP15509 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CSF2RAP15509 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CSF2RAP15509 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CSF2RAP15509 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CSF2RAP15509 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CSF2RAP15509 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CSF2RAP15509 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CSF2RAP15509 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CSF2RAP15509 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
CSF2RAP15509 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
CSF2RAP15509 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
CSF2RAP15509 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CSF2RAP15509 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CSF2RAP15509 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CSF2RAP15509 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CSF2RAP15509 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CSF2RAP15509 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CSF2RAP15509 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CSF2RAP15509 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CSF2RAP15509 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CSF2RAP15509 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CSF2RAP15509 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
CSF2RAP15509 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CSF2RAP15509 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CSF2RAP15509 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CSF2RAP15509 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CSF2RAP15509 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CSF2RAP15509 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CSF2RAP15509 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CSF2RAP15509 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CSF2RAP15509 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CSF2RAP15509 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CSF2RAP15509 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CSF2RAP15509 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CSF2RAP15509 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CSF2RAP15509 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CSF2RAP15509 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CSF2RAP15509 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CSF2RAP15509 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CSF2RAP15509 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CSF2RAP15509 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CSF2RAP15509 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CSF2RAP15509 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CSF2RAP15509 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CSF2RAP15509 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CSF2RAP15509 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CSF2RAP15509 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CSF2RAP15509 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CSF2RAP15509 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CSF2RAP15509 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CSF2RAP15509 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
CSF2RAP15509 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CSF2RAP15509 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CSF2RAP15509 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CSF2RAP15509 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
CSF2RAP15509 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CSF2RAP15509 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CSF2RAP15509 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CSF2RAP15509 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CSF2RAP15509 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CSF2RAP15509 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CSF2RAP15509 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CSF2RAP15509 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
CSF2RAP15509 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CSF2RAP15509 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CSF2RAP15509 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CSF2RAP15509 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
CSF2RAP15509 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CSF2RAP15509 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CSF2RAP15509 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CSF2RAP15509 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CSF2RAP15509 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CSF2RAP15509 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CSF2RAP15509 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CSF2RAP15509 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CSF2RAP15509 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CSF2RAP15509 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CSF2RAP15509 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CSF2RAP15509 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CSF2RAP15509 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CSF2RAP15509 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
CSF2RAP15509 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
CSF2RAP15509 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CSF2RAP15509 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CSF2RAP15509 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CSF2RAP15509 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CSF2RAP15509 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CSF2RAP15509 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
CSF2RAP15509 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CSF2RAP15509 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CSF2RAP15509 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
CSF2RAP15509 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CSF2RAP15509 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CSF2RAP15509 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
CSF2RAP15509 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.2 ms