Protein–RNA interactions for Protein: P15056

BRAF, Serine/threonine-protein kinase B-raf, humanhuman

Predictions only

Length 766 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRAFP15056 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
BRAFP15056 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
BRAFP15056 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
BRAFP15056 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
BRAFP15056 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
BRAFP15056 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC22.84■■□□□ 1.25
BRAFP15056 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
BRAFP15056 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
BRAFP15056 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
BRAFP15056 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
BRAFP15056 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
BRAFP15056 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
BRAFP15056 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
BRAFP15056 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
BRAFP15056 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
BRAFP15056 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
BRAFP15056 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
BRAFP15056 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
BRAFP15056 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
BRAFP15056 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
BRAFP15056 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
BRAFP15056 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
BRAFP15056 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
BRAFP15056 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
BRAFP15056 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
BRAFP15056 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
BRAFP15056 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
BRAFP15056 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
BRAFP15056 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
BRAFP15056 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
BRAFP15056 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
BRAFP15056 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
BRAFP15056 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
BRAFP15056 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
BRAFP15056 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
BRAFP15056 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
BRAFP15056 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
BRAFP15056 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
BRAFP15056 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
BRAFP15056 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
BRAFP15056 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
BRAFP15056 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
BRAFP15056 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
BRAFP15056 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
BRAFP15056 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
BRAFP15056 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
BRAFP15056 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
BRAFP15056 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
BRAFP15056 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
BRAFP15056 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
BRAFP15056 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
BRAFP15056 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
BRAFP15056 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
BRAFP15056 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
BRAFP15056 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
BRAFP15056 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
BRAFP15056 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
BRAFP15056 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
BRAFP15056 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
BRAFP15056 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
BRAFP15056 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
BRAFP15056 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
BRAFP15056 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
BRAFP15056 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
BRAFP15056 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
BRAFP15056 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
BRAFP15056 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
BRAFP15056 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
BRAFP15056 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
BRAFP15056 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
BRAFP15056 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
BRAFP15056 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
BRAFP15056 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
BRAFP15056 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
BRAFP15056 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
BRAFP15056 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
BRAFP15056 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
BRAFP15056 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
BRAFP15056 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
BRAFP15056 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
BRAFP15056 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
BRAFP15056 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
BRAFP15056 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
BRAFP15056 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
BRAFP15056 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
BRAFP15056 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
BRAFP15056 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
BRAFP15056 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
BRAFP15056 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
BRAFP15056 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
BRAFP15056 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
BRAFP15056 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
BRAFP15056 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
BRAFP15056 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
BRAFP15056 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
BRAFP15056 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
BRAFP15056 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
BRAFP15056 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
BRAFP15056 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
BRAFP15056 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms