Protein–RNA interactions for Protein: P13984

GTF2F2, General transcription factor IIF subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2F2P13984 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
GTF2F2P13984 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
GTF2F2P13984 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
GTF2F2P13984 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
GTF2F2P13984 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
GTF2F2P13984 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
GTF2F2P13984 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
GTF2F2P13984 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
GTF2F2P13984 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
GTF2F2P13984 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
GTF2F2P13984 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
GTF2F2P13984 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
GTF2F2P13984 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
GTF2F2P13984 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
GTF2F2P13984 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
GTF2F2P13984 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
GTF2F2P13984 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
GTF2F2P13984 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
GTF2F2P13984 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
GTF2F2P13984 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
GTF2F2P13984 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
GTF2F2P13984 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
GTF2F2P13984 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
GTF2F2P13984 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
GTF2F2P13984 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
GTF2F2P13984 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
GTF2F2P13984 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
GTF2F2P13984 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
GTF2F2P13984 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
GTF2F2P13984 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
GTF2F2P13984 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
GTF2F2P13984 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
GTF2F2P13984 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
GTF2F2P13984 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
GTF2F2P13984 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
GTF2F2P13984 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
GTF2F2P13984 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
GTF2F2P13984 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
GTF2F2P13984 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
GTF2F2P13984 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
GTF2F2P13984 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
GTF2F2P13984 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
GTF2F2P13984 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
GTF2F2P13984 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
GTF2F2P13984 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
GTF2F2P13984 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
GTF2F2P13984 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
GTF2F2P13984 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
GTF2F2P13984 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
GTF2F2P13984 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
GTF2F2P13984 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
GTF2F2P13984 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
GTF2F2P13984 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
GTF2F2P13984 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
GTF2F2P13984 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
GTF2F2P13984 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
GTF2F2P13984 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
GTF2F2P13984 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
GTF2F2P13984 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
GTF2F2P13984 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
GTF2F2P13984 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
GTF2F2P13984 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
GTF2F2P13984 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
GTF2F2P13984 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
GTF2F2P13984 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
GTF2F2P13984 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
GTF2F2P13984 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
GTF2F2P13984 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
GTF2F2P13984 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
GTF2F2P13984 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
GTF2F2P13984 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
GTF2F2P13984 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
GTF2F2P13984 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
GTF2F2P13984 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
GTF2F2P13984 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
GTF2F2P13984 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
GTF2F2P13984 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
GTF2F2P13984 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
GTF2F2P13984 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
GTF2F2P13984 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
GTF2F2P13984 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
GTF2F2P13984 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.68
GTF2F2P13984 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
GTF2F2P13984 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
GTF2F2P13984 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
GTF2F2P13984 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
GTF2F2P13984 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
GTF2F2P13984 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
GTF2F2P13984 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
GTF2F2P13984 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
GTF2F2P13984 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
GTF2F2P13984 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
GTF2F2P13984 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
GTF2F2P13984 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
GTF2F2P13984 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
GTF2F2P13984 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
GTF2F2P13984 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
GTF2F2P13984 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
GTF2F2P13984 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
GTF2F2P13984 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms