Protein–RNA interactions for Protein: P13796

LCP1, Plastin-2, humanhuman

Predictions only

Length 627 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LCP1P13796 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
LCP1P13796 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
LCP1P13796 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
LCP1P13796 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
LCP1P13796 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
LCP1P13796 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
LCP1P13796 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC23.51■■□□□ 1.35
LCP1P13796 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
LCP1P13796 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
LCP1P13796 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
LCP1P13796 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
LCP1P13796 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
LCP1P13796 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
LCP1P13796 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
LCP1P13796 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
LCP1P13796 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
LCP1P13796 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
LCP1P13796 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
LCP1P13796 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
LCP1P13796 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
LCP1P13796 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
LCP1P13796 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
LCP1P13796 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
LCP1P13796 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
LCP1P13796 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
LCP1P13796 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
LCP1P13796 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
LCP1P13796 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
LCP1P13796 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
LCP1P13796 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
LCP1P13796 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
LCP1P13796 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
LCP1P13796 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
LCP1P13796 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
LCP1P13796 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
LCP1P13796 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
LCP1P13796 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
LCP1P13796 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
LCP1P13796 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
LCP1P13796 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
LCP1P13796 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
LCP1P13796 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
LCP1P13796 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
LCP1P13796 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LCP1P13796 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
LCP1P13796 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
LCP1P13796 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LCP1P13796 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
LCP1P13796 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
LCP1P13796 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
LCP1P13796 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
LCP1P13796 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
LCP1P13796 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
LCP1P13796 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
LCP1P13796 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LCP1P13796 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
LCP1P13796 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
LCP1P13796 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LCP1P13796 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LCP1P13796 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
LCP1P13796 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
LCP1P13796 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
LCP1P13796 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
LCP1P13796 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
LCP1P13796 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
LCP1P13796 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
LCP1P13796 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
LCP1P13796 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
LCP1P13796 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
LCP1P13796 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
LCP1P13796 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
LCP1P13796 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
LCP1P13796 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
LCP1P13796 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
LCP1P13796 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
LCP1P13796 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
LCP1P13796 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
LCP1P13796 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
LCP1P13796 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
LCP1P13796 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
LCP1P13796 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
LCP1P13796 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
LCP1P13796 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
LCP1P13796 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
LCP1P13796 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
LCP1P13796 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
LCP1P13796 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
LCP1P13796 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
LCP1P13796 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
LCP1P13796 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LCP1P13796 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
LCP1P13796 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
LCP1P13796 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
LCP1P13796 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
LCP1P13796 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
LCP1P13796 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LCP1P13796 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
LCP1P13796 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LCP1P13796 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
LCP1P13796 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.1 ms