Protein–RNA interactions for Protein: P13569

CFTR, Cystic fibrosis transmembrane conductance regulator, humanhuman

Predictions only

Length 1,480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFTRP13569 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.03■■■■□ 3.84
CFTRP13569 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC39.03■■■■□ 3.84
CFTRP13569 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.03■■■■□ 3.84
CFTRP13569 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.03■■■■□ 3.84
CFTRP13569 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC39.03■■■■□ 3.84
CFTRP13569 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC39.03■■■■□ 3.84
CFTRP13569 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC39.03■■■■□ 3.84
CFTRP13569 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC39.03■■■■□ 3.84
CFTRP13569 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.03■■■■□ 3.84
CFTRP13569 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC39.03■■■■□ 3.84
CFTRP13569 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.03■■■■□ 3.84
CFTRP13569 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC39.02■■■■□ 3.84
CFTRP13569 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC39.02■■■■□ 3.84
CFTRP13569 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC39.02■■■■□ 3.84
CFTRP13569 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC39.02■■■■□ 3.84
CFTRP13569 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC39.02■■■■□ 3.84
CFTRP13569 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.02■■■■□ 3.84
CFTRP13569 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC39.02■■■■□ 3.84
CFTRP13569 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.02■■■■□ 3.84
CFTRP13569 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.01■■■■□ 3.84
CFTRP13569 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC39.01■■■■□ 3.84
CFTRP13569 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.01■■■■□ 3.84
CFTRP13569 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC39.01■■■■□ 3.84
CFTRP13569 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC39.01■■■■□ 3.83
CFTRP13569 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.01■■■■□ 3.83
CFTRP13569 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC39.01■■■■□ 3.83
CFTRP13569 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC39■■■■□ 3.83
CFTRP13569 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC39■■■■□ 3.83
CFTRP13569 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.99■■■■□ 3.83
CFTRP13569 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC38.99■■■■□ 3.83
CFTRP13569 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC38.99■■■■□ 3.83
CFTRP13569 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.99■■■■□ 3.83
CFTRP13569 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC38.99■■■■□ 3.83
CFTRP13569 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.99■■■■□ 3.83
CFTRP13569 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC38.99■■■■□ 3.83
CFTRP13569 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC38.98■■■■□ 3.83
CFTRP13569 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC38.98■■■■□ 3.83
CFTRP13569 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC38.98■■■■□ 3.83
CFTRP13569 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC38.98■■■■□ 3.83
CFTRP13569 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC38.98■■■■□ 3.83
CFTRP13569 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC38.97■■■■□ 3.83
CFTRP13569 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC38.97■■■■□ 3.83
CFTRP13569 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC38.97■■■■□ 3.83
CFTRP13569 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC38.97■■■■□ 3.83
CFTRP13569 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC38.97■■■■□ 3.83
CFTRP13569 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.97■■■■□ 3.83
CFTRP13569 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.96■■■■□ 3.83
CFTRP13569 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.96■■■■□ 3.83
CFTRP13569 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC38.96■■■■□ 3.83
CFTRP13569 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.95■■■■□ 3.83
CFTRP13569 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.95■■■■□ 3.83
CFTRP13569 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC38.95■■■■□ 3.83
CFTRP13569 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC38.95■■■■□ 3.83
CFTRP13569 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC38.94■■■■□ 3.82
CFTRP13569 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC38.94■■■■□ 3.82
CFTRP13569 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.94■■■■□ 3.82
CFTRP13569 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC38.94■■■■□ 3.82
CFTRP13569 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC38.94■■■■□ 3.82
CFTRP13569 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC38.94■■■■□ 3.82
CFTRP13569 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC38.94■■■■□ 3.82
CFTRP13569 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.94■■■■□ 3.82
CFTRP13569 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.94■■■■□ 3.82
CFTRP13569 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.94■■■■□ 3.82
CFTRP13569 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.94■■■■□ 3.82
CFTRP13569 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.93■■■■□ 3.82
CFTRP13569 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.93■■■■□ 3.82
CFTRP13569 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC38.93■■■■□ 3.82
CFTRP13569 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC38.93■■■■□ 3.82
CFTRP13569 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.93■■■■□ 3.82
CFTRP13569 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC38.93■■■■□ 3.82
CFTRP13569 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.93■■■■□ 3.82
CFTRP13569 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.92■■■■□ 3.82
CFTRP13569 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC38.92■■■■□ 3.82
CFTRP13569 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.92■■■■□ 3.82
CFTRP13569 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.92■■■■□ 3.82
CFTRP13569 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC38.92■■■■□ 3.82
CFTRP13569 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC38.92■■■■□ 3.82
CFTRP13569 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC38.92■■■■□ 3.82
CFTRP13569 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.91■■■■□ 3.82
CFTRP13569 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC38.91■■■■□ 3.82
CFTRP13569 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC38.91■■■■□ 3.82
CFTRP13569 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.91■■■■□ 3.82
CFTRP13569 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.9■■■■□ 3.82
CFTRP13569 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.9■■■■□ 3.82
CFTRP13569 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.89■■■■□ 3.82
CFTRP13569 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC38.89■■■■□ 3.82
CFTRP13569 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.89■■■■□ 3.82
CFTRP13569 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.89■■■■□ 3.82
CFTRP13569 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC38.89■■■■□ 3.82
CFTRP13569 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC38.89■■■■□ 3.82
CFTRP13569 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC38.89■■■■□ 3.82
CFTRP13569 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.88■■■■□ 3.82
CFTRP13569 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC38.88■■■■□ 3.81
CFTRP13569 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC38.88■■■■□ 3.81
CFTRP13569 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC38.88■■■■□ 3.81
CFTRP13569 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC38.88■■■■□ 3.81
CFTRP13569 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC38.88■■■■□ 3.81
CFTRP13569 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC38.88■■■■□ 3.81
CFTRP13569 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC38.87■■■■□ 3.81
CFTRP13569 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.86■■■■□ 3.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.5 ms