Protein–RNA interactions for Protein: P12081

HARS, Histidine--tRNA ligase, cytoplasmic, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 509 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HARSP12081 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
HARSP12081 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
HARSP12081 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
HARSP12081 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
HARSP12081 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
HARSP12081 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
HARSP12081 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
HARSP12081 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
HARSP12081 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
HARSP12081 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
HARSP12081 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
HARSP12081 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
HARSP12081 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
HARSP12081 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.39■■□□□ 1.49
HARSP12081 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
HARSP12081 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
HARSP12081 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
HARSP12081 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
HARSP12081 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
HARSP12081 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
HARSP12081 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
HARSP12081 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
HARSP12081 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
HARSP12081 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
HARSP12081 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
HARSP12081 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
HARSP12081 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
HARSP12081 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
HARSP12081 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
HARSP12081 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
HARSP12081 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
HARSP12081 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
HARSP12081 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
HARSP12081 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
HARSP12081 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
HARSP12081 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
HARSP12081 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
HARSP12081 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
HARSP12081 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
HARSP12081 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
HARSP12081 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
HARSP12081 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
HARSP12081 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
HARSP12081 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
HARSP12081 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
HARSP12081 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
HARSP12081 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
HARSP12081 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
HARSP12081 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
HARSP12081 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
HARSP12081 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
HARSP12081 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
HARSP12081 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
HARSP12081 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
HARSP12081 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
HARSP12081 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
HARSP12081 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
HARSP12081 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
HARSP12081 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
HARSP12081 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
HARSP12081 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
HARSP12081 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
HARSP12081 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
HARSP12081 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
HARSP12081 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
HARSP12081 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
HARSP12081 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
HARSP12081 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
HARSP12081 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
HARSP12081 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
HARSP12081 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
HARSP12081 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
HARSP12081 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
HARSP12081 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
HARSP12081 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
HARSP12081 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
HARSP12081 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
HARSP12081 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
HARSP12081 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
HARSP12081 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
HARSP12081 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
HARSP12081 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
HARSP12081 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
HARSP12081 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
HARSP12081 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
HARSP12081 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
HARSP12081 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
HARSP12081 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
HARSP12081 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
HARSP12081 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
HARSP12081 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
HARSP12081 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
HARSP12081 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
HARSP12081 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
HARSP12081 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
HARSP12081 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
HARSP12081 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
HARSP12081 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
HARSP12081 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
HARSP12081 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms