Protein–RNA interactions for Protein: P11473

VDR, Vitamin D3 receptor, humanhuman

Predictions only

Length 427 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VDRP11473 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
VDRP11473 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
VDRP11473 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
VDRP11473 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
VDRP11473 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
VDRP11473 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
VDRP11473 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
VDRP11473 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
VDRP11473 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
VDRP11473 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
VDRP11473 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
VDRP11473 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
VDRP11473 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
VDRP11473 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
VDRP11473 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
VDRP11473 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
VDRP11473 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
VDRP11473 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
VDRP11473 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
VDRP11473 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
VDRP11473 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
VDRP11473 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
VDRP11473 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
VDRP11473 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
VDRP11473 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
VDRP11473 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
VDRP11473 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
VDRP11473 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
VDRP11473 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
VDRP11473 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
VDRP11473 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
VDRP11473 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
VDRP11473 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
VDRP11473 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
VDRP11473 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
VDRP11473 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
VDRP11473 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
VDRP11473 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
VDRP11473 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
VDRP11473 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
VDRP11473 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
VDRP11473 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
VDRP11473 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
VDRP11473 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
VDRP11473 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
VDRP11473 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
VDRP11473 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
VDRP11473 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
VDRP11473 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
VDRP11473 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
VDRP11473 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
VDRP11473 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
VDRP11473 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
VDRP11473 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
VDRP11473 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
VDRP11473 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
VDRP11473 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
VDRP11473 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
VDRP11473 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
VDRP11473 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
VDRP11473 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
VDRP11473 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
VDRP11473 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
VDRP11473 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
VDRP11473 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
VDRP11473 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
VDRP11473 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
VDRP11473 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
VDRP11473 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
VDRP11473 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
VDRP11473 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
VDRP11473 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
VDRP11473 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
VDRP11473 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC23.61■■□□□ 1.37
VDRP11473 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
VDRP11473 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
VDRP11473 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
VDRP11473 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
VDRP11473 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
VDRP11473 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
VDRP11473 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
VDRP11473 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
VDRP11473 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
VDRP11473 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
VDRP11473 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
VDRP11473 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
VDRP11473 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
VDRP11473 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
VDRP11473 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
VDRP11473 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
VDRP11473 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
VDRP11473 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
VDRP11473 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
VDRP11473 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
VDRP11473 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
VDRP11473 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
VDRP11473 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC23.59■■□□□ 1.37
VDRP11473 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
VDRP11473 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
VDRP11473 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms