Protein–RNA interactions for Protein: P10645

CHGA, Chromogranin-A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 457 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHGAP10645 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
CHGAP10645 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
CHGAP10645 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC32.39■■■□□ 2.78
CHGAP10645 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
CHGAP10645 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC32.39■■■□□ 2.78
CHGAP10645 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.39■■■□□ 2.78
CHGAP10645 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
CHGAP10645 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
CHGAP10645 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
CHGAP10645 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
CHGAP10645 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
CHGAP10645 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC32.38■■■□□ 2.77
CHGAP10645 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC32.38■■■□□ 2.77
CHGAP10645 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
CHGAP10645 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC32.38■■■□□ 2.77
CHGAP10645 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC32.38■■■□□ 2.77
CHGAP10645 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.38■■■□□ 2.77
CHGAP10645 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC32.38■■■□□ 2.77
CHGAP10645 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
CHGAP10645 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
CHGAP10645 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
CHGAP10645 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
CHGAP10645 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC32.37■■■□□ 2.77
CHGAP10645 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC32.37■■■□□ 2.77
CHGAP10645 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.36■■■□□ 2.77
CHGAP10645 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC32.36■■■□□ 2.77
CHGAP10645 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC32.36■■■□□ 2.77
CHGAP10645 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.36■■■□□ 2.77
CHGAP10645 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.36■■■□□ 2.77
CHGAP10645 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC32.35■■■□□ 2.77
CHGAP10645 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
CHGAP10645 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
CHGAP10645 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC32.35■■■□□ 2.77
CHGAP10645 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.35■■■□□ 2.77
CHGAP10645 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
CHGAP10645 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC32.35■■■□□ 2.77
CHGAP10645 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC32.35■■■□□ 2.77
CHGAP10645 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC32.35■■■□□ 2.77
CHGAP10645 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.35■■■□□ 2.77
CHGAP10645 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
CHGAP10645 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
CHGAP10645 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.35■■■□□ 2.77
CHGAP10645 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
CHGAP10645 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
CHGAP10645 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
CHGAP10645 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
CHGAP10645 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC32.34■■■□□ 2.77
CHGAP10645 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
CHGAP10645 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
CHGAP10645 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
CHGAP10645 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
CHGAP10645 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
CHGAP10645 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC32.34■■■□□ 2.77
CHGAP10645 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC32.34■■■□□ 2.77
CHGAP10645 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
CHGAP10645 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC32.34■■■□□ 2.77
CHGAP10645 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
CHGAP10645 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.34■■■□□ 2.77
CHGAP10645 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
CHGAP10645 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC32.34■■■□□ 2.77
CHGAP10645 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC32.33■■■□□ 2.77
CHGAP10645 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
CHGAP10645 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
CHGAP10645 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
CHGAP10645 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
CHGAP10645 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC32.33■■■□□ 2.77
CHGAP10645 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC32.33■■■□□ 2.77
CHGAP10645 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.33■■■□□ 2.77
CHGAP10645 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
CHGAP10645 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC32.33■■■□□ 2.77
CHGAP10645 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
CHGAP10645 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.33■■■□□ 2.77
CHGAP10645 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
CHGAP10645 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
CHGAP10645 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
CHGAP10645 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC32.32■■■□□ 2.76
CHGAP10645 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC32.32■■■□□ 2.76
CHGAP10645 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
CHGAP10645 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC32.32■■■□□ 2.76
CHGAP10645 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC32.32■■■□□ 2.76
CHGAP10645 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
CHGAP10645 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
CHGAP10645 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC32.31■■■□□ 2.76
CHGAP10645 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
CHGAP10645 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
CHGAP10645 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC32.31■■■□□ 2.76
CHGAP10645 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.31■■■□□ 2.76
CHGAP10645 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC32.31■■■□□ 2.76
CHGAP10645 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC32.31■■■□□ 2.76
CHGAP10645 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
CHGAP10645 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC32.31■■■□□ 2.76
CHGAP10645 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
CHGAP10645 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
CHGAP10645 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
CHGAP10645 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
CHGAP10645 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
CHGAP10645 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
CHGAP10645 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
CHGAP10645 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC32.3■■■□□ 2.76
CHGAP10645 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC32.3■■■□□ 2.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms