Protein–RNA interactions for Protein: P0DMP2

SRGAP2B, SLIT-ROBO Rho GTPase-activating protein 2B, humanhuman

Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRGAP2BP0DMP2 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SRGAP2BP0DMP2 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SRGAP2BP0DMP2 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SRGAP2BP0DMP2 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SRGAP2BP0DMP2 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SRGAP2BP0DMP2 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SRGAP2BP0DMP2 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
SRGAP2BP0DMP2 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SRGAP2BP0DMP2 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SRGAP2BP0DMP2 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SRGAP2BP0DMP2 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SRGAP2BP0DMP2 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SRGAP2BP0DMP2 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SRGAP2BP0DMP2 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SRGAP2BP0DMP2 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SRGAP2BP0DMP2 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SRGAP2BP0DMP2 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
SRGAP2BP0DMP2 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SRGAP2BP0DMP2 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
SRGAP2BP0DMP2 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
SRGAP2BP0DMP2 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
SRGAP2BP0DMP2 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
SRGAP2BP0DMP2 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
SRGAP2BP0DMP2 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
SRGAP2BP0DMP2 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SRGAP2BP0DMP2 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SRGAP2BP0DMP2 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SRGAP2BP0DMP2 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
SRGAP2BP0DMP2 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
SRGAP2BP0DMP2 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
SRGAP2BP0DMP2 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
SRGAP2BP0DMP2 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SRGAP2BP0DMP2 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SRGAP2BP0DMP2 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
SRGAP2BP0DMP2 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SRGAP2BP0DMP2 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
SRGAP2BP0DMP2 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SRGAP2BP0DMP2 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SRGAP2BP0DMP2 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SRGAP2BP0DMP2 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SRGAP2BP0DMP2 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SRGAP2BP0DMP2 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SRGAP2BP0DMP2 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SRGAP2BP0DMP2 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
SRGAP2BP0DMP2 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SRGAP2BP0DMP2 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SRGAP2BP0DMP2 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SRGAP2BP0DMP2 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SRGAP2BP0DMP2 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SRGAP2BP0DMP2 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SRGAP2BP0DMP2 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SRGAP2BP0DMP2 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SRGAP2BP0DMP2 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SRGAP2BP0DMP2 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SRGAP2BP0DMP2 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SRGAP2BP0DMP2 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SRGAP2BP0DMP2 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SRGAP2BP0DMP2 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SRGAP2BP0DMP2 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
SRGAP2BP0DMP2 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SRGAP2BP0DMP2 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SRGAP2BP0DMP2 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SRGAP2BP0DMP2 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SRGAP2BP0DMP2 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SRGAP2BP0DMP2 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SRGAP2BP0DMP2 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SRGAP2BP0DMP2 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SRGAP2BP0DMP2 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SRGAP2BP0DMP2 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SRGAP2BP0DMP2 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SRGAP2BP0DMP2 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SRGAP2BP0DMP2 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SRGAP2BP0DMP2 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SRGAP2BP0DMP2 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SRGAP2BP0DMP2 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SRGAP2BP0DMP2 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SRGAP2BP0DMP2 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
SRGAP2BP0DMP2 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SRGAP2BP0DMP2 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SRGAP2BP0DMP2 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SRGAP2BP0DMP2 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SRGAP2BP0DMP2 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SRGAP2BP0DMP2 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SRGAP2BP0DMP2 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
SRGAP2BP0DMP2 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SRGAP2BP0DMP2 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
SRGAP2BP0DMP2 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SRGAP2BP0DMP2 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SRGAP2BP0DMP2 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SRGAP2BP0DMP2 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SRGAP2BP0DMP2 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SRGAP2BP0DMP2 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SRGAP2BP0DMP2 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SRGAP2BP0DMP2 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SRGAP2BP0DMP2 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SRGAP2BP0DMP2 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SRGAP2BP0DMP2 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SRGAP2BP0DMP2 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SRGAP2BP0DMP2 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SRGAP2BP0DMP2 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.9 ms