Protein–RNA interactions for Protein: P0CW27

CCDC166, Coiled-coil domain-containing protein 166, humanhuman

Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC166P0CW27 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC166P0CW27 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC166P0CW27 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC166P0CW27 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC166P0CW27 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC166P0CW27 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC166P0CW27 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC166P0CW27 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC166P0CW27 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC166P0CW27 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC166P0CW27 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC166P0CW27 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC166P0CW27 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC166P0CW27 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC166P0CW27 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC166P0CW27 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC166P0CW27 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC166P0CW27 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC166P0CW27 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC166P0CW27 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC166P0CW27 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC166P0CW27 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC166P0CW27 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC166P0CW27 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC166P0CW27 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC166P0CW27 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC166P0CW27 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC166P0CW27 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC166P0CW27 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC166P0CW27 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC166P0CW27 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC166P0CW27 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC166P0CW27 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC166P0CW27 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC166P0CW27 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC166P0CW27 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC166P0CW27 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC166P0CW27 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC166P0CW27 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC166P0CW27 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC166P0CW27 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC166P0CW27 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC166P0CW27 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC166P0CW27 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC166P0CW27 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC166P0CW27 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC166P0CW27 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC166P0CW27 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC166P0CW27 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC166P0CW27 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC166P0CW27 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC166P0CW27 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC166P0CW27 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC166P0CW27 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC166P0CW27 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC166P0CW27 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC166P0CW27 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC166P0CW27 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC166P0CW27 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC166P0CW27 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC166P0CW27 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC166P0CW27 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC166P0CW27 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC166P0CW27 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC166P0CW27 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC166P0CW27 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC166P0CW27 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC166P0CW27 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC166P0CW27 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC166P0CW27 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC166P0CW27 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC166P0CW27 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC166P0CW27 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC166P0CW27 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC166P0CW27 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC166P0CW27 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC166P0CW27 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC166P0CW27 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC166P0CW27 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC166P0CW27 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC166P0CW27 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC166P0CW27 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC166P0CW27 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC166P0CW27 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC166P0CW27 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC166P0CW27 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC166P0CW27 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC166P0CW27 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC166P0CW27 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC166P0CW27 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC166P0CW27 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC166P0CW27 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC166P0CW27 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC166P0CW27 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC166P0CW27 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC166P0CW27 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC166P0CW27 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC166P0CW27 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC166P0CW27 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC166P0CW27 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms