Protein–RNA interactions for Protein: P0CW24

PNMA6A, Paraneoplastic antigen-like protein 6A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 399 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PNMA6AP0CW24 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PNMA6AP0CW24 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PNMA6AP0CW24 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PNMA6AP0CW24 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PNMA6AP0CW24 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PNMA6AP0CW24 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PNMA6AP0CW24 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PNMA6AP0CW24 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PNMA6AP0CW24 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
PNMA6AP0CW24 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PNMA6AP0CW24 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PNMA6AP0CW24 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PNMA6AP0CW24 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PNMA6AP0CW24 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PNMA6AP0CW24 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PNMA6AP0CW24 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PNMA6AP0CW24 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PNMA6AP0CW24 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
PNMA6AP0CW24 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PNMA6AP0CW24 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PNMA6AP0CW24 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PNMA6AP0CW24 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PNMA6AP0CW24 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PNMA6AP0CW24 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PNMA6AP0CW24 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PNMA6AP0CW24 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PNMA6AP0CW24 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PNMA6AP0CW24 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PNMA6AP0CW24 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PNMA6AP0CW24 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PNMA6AP0CW24 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PNMA6AP0CW24 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PNMA6AP0CW24 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PNMA6AP0CW24 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PNMA6AP0CW24 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PNMA6AP0CW24 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PNMA6AP0CW24 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PNMA6AP0CW24 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PNMA6AP0CW24 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PNMA6AP0CW24 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PNMA6AP0CW24 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PNMA6AP0CW24 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PNMA6AP0CW24 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PNMA6AP0CW24 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PNMA6AP0CW24 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PNMA6AP0CW24 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PNMA6AP0CW24 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PNMA6AP0CW24 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PNMA6AP0CW24 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PNMA6AP0CW24 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
PNMA6AP0CW24 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PNMA6AP0CW24 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PNMA6AP0CW24 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PNMA6AP0CW24 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PNMA6AP0CW24 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PNMA6AP0CW24 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PNMA6AP0CW24 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PNMA6AP0CW24 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PNMA6AP0CW24 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PNMA6AP0CW24 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PNMA6AP0CW24 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PNMA6AP0CW24 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PNMA6AP0CW24 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PNMA6AP0CW24 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PNMA6AP0CW24 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PNMA6AP0CW24 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PNMA6AP0CW24 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PNMA6AP0CW24 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PNMA6AP0CW24 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PNMA6AP0CW24 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PNMA6AP0CW24 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PNMA6AP0CW24 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
PNMA6AP0CW24 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PNMA6AP0CW24 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PNMA6AP0CW24 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PNMA6AP0CW24 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PNMA6AP0CW24 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PNMA6AP0CW24 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PNMA6AP0CW24 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PNMA6AP0CW24 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PNMA6AP0CW24 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PNMA6AP0CW24 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PNMA6AP0CW24 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PNMA6AP0CW24 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PNMA6AP0CW24 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PNMA6AP0CW24 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PNMA6AP0CW24 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PNMA6AP0CW24 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PNMA6AP0CW24 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PNMA6AP0CW24 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PNMA6AP0CW24 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PNMA6AP0CW24 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PNMA6AP0CW24 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PNMA6AP0CW24 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PNMA6AP0CW24 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
PNMA6AP0CW24 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PNMA6AP0CW24 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
PNMA6AP0CW24 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PNMA6AP0CW24 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PNMA6AP0CW24 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms