Protein–RNA interactions for Protein: P0C875

FAM228B, Protein FAM228B, humanhuman

Predictions only

Length 321 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM228BP0C875 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
FAM228BP0C875 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
FAM228BP0C875 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
FAM228BP0C875 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
FAM228BP0C875 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
FAM228BP0C875 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
FAM228BP0C875 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
FAM228BP0C875 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
FAM228BP0C875 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
FAM228BP0C875 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
FAM228BP0C875 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
FAM228BP0C875 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
FAM228BP0C875 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
FAM228BP0C875 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
FAM228BP0C875 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
FAM228BP0C875 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
FAM228BP0C875 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
FAM228BP0C875 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
FAM228BP0C875 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
FAM228BP0C875 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
FAM228BP0C875 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
FAM228BP0C875 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
FAM228BP0C875 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
FAM228BP0C875 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
FAM228BP0C875 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
FAM228BP0C875 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
FAM228BP0C875 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
FAM228BP0C875 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
FAM228BP0C875 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
FAM228BP0C875 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
FAM228BP0C875 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
FAM228BP0C875 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
FAM228BP0C875 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
FAM228BP0C875 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
FAM228BP0C875 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
FAM228BP0C875 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
FAM228BP0C875 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
FAM228BP0C875 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
FAM228BP0C875 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
FAM228BP0C875 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
FAM228BP0C875 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC23.82■■□□□ 1.4
FAM228BP0C875 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
FAM228BP0C875 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
FAM228BP0C875 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
FAM228BP0C875 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
FAM228BP0C875 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
FAM228BP0C875 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
FAM228BP0C875 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
FAM228BP0C875 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
FAM228BP0C875 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
FAM228BP0C875 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
FAM228BP0C875 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
FAM228BP0C875 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
FAM228BP0C875 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
FAM228BP0C875 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
FAM228BP0C875 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
FAM228BP0C875 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
FAM228BP0C875 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
FAM228BP0C875 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
FAM228BP0C875 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
FAM228BP0C875 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
FAM228BP0C875 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
FAM228BP0C875 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
FAM228BP0C875 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
FAM228BP0C875 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
FAM228BP0C875 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
FAM228BP0C875 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
FAM228BP0C875 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
FAM228BP0C875 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
FAM228BP0C875 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
FAM228BP0C875 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
FAM228BP0C875 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
FAM228BP0C875 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
FAM228BP0C875 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
FAM228BP0C875 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
FAM228BP0C875 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
FAM228BP0C875 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
FAM228BP0C875 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
FAM228BP0C875 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
FAM228BP0C875 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
FAM228BP0C875 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
FAM228BP0C875 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
FAM228BP0C875 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
FAM228BP0C875 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
FAM228BP0C875 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
FAM228BP0C875 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
FAM228BP0C875 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
FAM228BP0C875 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
FAM228BP0C875 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
FAM228BP0C875 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC23.78■■□□□ 1.4
FAM228BP0C875 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
FAM228BP0C875 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
FAM228BP0C875 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
FAM228BP0C875 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
FAM228BP0C875 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
FAM228BP0C875 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
FAM228BP0C875 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
FAM228BP0C875 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
FAM228BP0C875 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
FAM228BP0C875 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms