Protein–RNA interactions for Protein: P0C7W6

CCDC172, Coiled-coil domain-containing protein 172, humanhuman

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC172P0C7W6 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC172P0C7W6 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC172P0C7W6 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC172P0C7W6 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC172P0C7W6 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC172P0C7W6 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC172P0C7W6 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC172P0C7W6 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC172P0C7W6 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC172P0C7W6 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC172P0C7W6 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC172P0C7W6 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC172P0C7W6 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC172P0C7W6 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC172P0C7W6 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC172P0C7W6 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC172P0C7W6 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC172P0C7W6 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC172P0C7W6 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC172P0C7W6 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC172P0C7W6 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC172P0C7W6 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC172P0C7W6 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC172P0C7W6 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC172P0C7W6 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC172P0C7W6 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC172P0C7W6 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CCDC172P0C7W6 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CCDC172P0C7W6 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC24■■□□□ 1.43
CCDC172P0C7W6 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
CCDC172P0C7W6 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
CCDC172P0C7W6 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CCDC172P0C7W6 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CCDC172P0C7W6 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CCDC172P0C7W6 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CCDC172P0C7W6 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCDC172P0C7W6 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCDC172P0C7W6 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCDC172P0C7W6 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCDC172P0C7W6 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCDC172P0C7W6 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCDC172P0C7W6 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCDC172P0C7W6 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCDC172P0C7W6 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCDC172P0C7W6 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCDC172P0C7W6 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
CCDC172P0C7W6 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCDC172P0C7W6 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCDC172P0C7W6 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC172P0C7W6 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC172P0C7W6 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC172P0C7W6 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC172P0C7W6 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC172P0C7W6 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC172P0C7W6 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC172P0C7W6 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC172P0C7W6 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC172P0C7W6 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC172P0C7W6 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC172P0C7W6 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC172P0C7W6 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCDC172P0C7W6 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCDC172P0C7W6 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCDC172P0C7W6 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCDC172P0C7W6 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCDC172P0C7W6 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCDC172P0C7W6 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC172P0C7W6 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC172P0C7W6 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC172P0C7W6 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC172P0C7W6 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC172P0C7W6 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC172P0C7W6 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC172P0C7W6 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC172P0C7W6 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC172P0C7W6 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC172P0C7W6 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC172P0C7W6 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC172P0C7W6 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC172P0C7W6 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC172P0C7W6 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
CCDC172P0C7W6 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCDC172P0C7W6 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCDC172P0C7W6 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCDC172P0C7W6 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCDC172P0C7W6 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCDC172P0C7W6 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCDC172P0C7W6 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCDC172P0C7W6 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCDC172P0C7W6 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCDC172P0C7W6 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCDC172P0C7W6 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC172P0C7W6 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC172P0C7W6 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC172P0C7W6 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC172P0C7W6 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC172P0C7W6 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC172P0C7W6 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC172P0C7W6 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC172P0C7W6 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.3 ms