Protein–RNA interactions for Protein: P0C7I6

CCDC159, Coiled-coil domain-containing protein 159, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC159P0C7I6 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC159P0C7I6 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC159P0C7I6 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC159P0C7I6 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC159P0C7I6 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC159P0C7I6 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC159P0C7I6 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC159P0C7I6 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC159P0C7I6 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC159P0C7I6 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC159P0C7I6 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC159P0C7I6 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC159P0C7I6 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC159P0C7I6 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC159P0C7I6 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC159P0C7I6 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC159P0C7I6 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC159P0C7I6 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC159P0C7I6 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC159P0C7I6 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC159P0C7I6 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC159P0C7I6 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC159P0C7I6 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC159P0C7I6 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC159P0C7I6 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC159P0C7I6 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC159P0C7I6 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC159P0C7I6 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC159P0C7I6 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC159P0C7I6 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC159P0C7I6 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC159P0C7I6 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC159P0C7I6 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC159P0C7I6 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC159P0C7I6 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC159P0C7I6 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC159P0C7I6 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC159P0C7I6 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC159P0C7I6 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC159P0C7I6 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC159P0C7I6 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC159P0C7I6 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC159P0C7I6 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC159P0C7I6 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC159P0C7I6 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC159P0C7I6 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC159P0C7I6 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC159P0C7I6 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC159P0C7I6 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC159P0C7I6 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC159P0C7I6 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC159P0C7I6 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC159P0C7I6 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC159P0C7I6 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC159P0C7I6 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC159P0C7I6 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC159P0C7I6 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC159P0C7I6 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC159P0C7I6 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC159P0C7I6 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC159P0C7I6 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC159P0C7I6 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC159P0C7I6 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC159P0C7I6 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC159P0C7I6 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC159P0C7I6 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC159P0C7I6 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC159P0C7I6 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC159P0C7I6 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC159P0C7I6 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC159P0C7I6 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC159P0C7I6 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC159P0C7I6 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC159P0C7I6 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC159P0C7I6 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC159P0C7I6 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC159P0C7I6 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC159P0C7I6 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC159P0C7I6 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC159P0C7I6 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC159P0C7I6 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC159P0C7I6 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC159P0C7I6 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC159P0C7I6 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
CCDC159P0C7I6 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC159P0C7I6 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC159P0C7I6 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC159P0C7I6 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC159P0C7I6 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC159P0C7I6 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC159P0C7I6 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC159P0C7I6 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC159P0C7I6 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC159P0C7I6 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC159P0C7I6 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC159P0C7I6 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC159P0C7I6 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC159P0C7I6 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC159P0C7I6 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC159P0C7I6 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.9 ms