Protein–RNA interactions for Protein: P0C2W7

CT47B1, Cancer/testis antigen 47B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 299 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CT47B1P0C2W7 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
CT47B1P0C2W7 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
CT47B1P0C2W7 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
CT47B1P0C2W7 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
CT47B1P0C2W7 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
CT47B1P0C2W7 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
CT47B1P0C2W7 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.19
CT47B1P0C2W7 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
CT47B1P0C2W7 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.19
CT47B1P0C2W7 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
CT47B1P0C2W7 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
CT47B1P0C2W7 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
CT47B1P0C2W7 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC28.7■■■□□ 2.18
CT47B1P0C2W7 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
CT47B1P0C2W7 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC28.7■■■□□ 2.18
CT47B1P0C2W7 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
CT47B1P0C2W7 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
CT47B1P0C2W7 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
CT47B1P0C2W7 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
CT47B1P0C2W7 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
CT47B1P0C2W7 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
CT47B1P0C2W7 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
CT47B1P0C2W7 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
CT47B1P0C2W7 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
CT47B1P0C2W7 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
CT47B1P0C2W7 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
CT47B1P0C2W7 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
CT47B1P0C2W7 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC28.68■■■□□ 2.18
CT47B1P0C2W7 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
CT47B1P0C2W7 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
CT47B1P0C2W7 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
CT47B1P0C2W7 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
CT47B1P0C2W7 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
CT47B1P0C2W7 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
CT47B1P0C2W7 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC28.67■■■□□ 2.18
CT47B1P0C2W7 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
CT47B1P0C2W7 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
CT47B1P0C2W7 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
CT47B1P0C2W7 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
CT47B1P0C2W7 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
CT47B1P0C2W7 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
CT47B1P0C2W7 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
CT47B1P0C2W7 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
CT47B1P0C2W7 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
CT47B1P0C2W7 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
CT47B1P0C2W7 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
CT47B1P0C2W7 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
CT47B1P0C2W7 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
CT47B1P0C2W7 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
CT47B1P0C2W7 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
CT47B1P0C2W7 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
CT47B1P0C2W7 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
CT47B1P0C2W7 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC28.65■■■□□ 2.18
CT47B1P0C2W7 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
CT47B1P0C2W7 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
CT47B1P0C2W7 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
CT47B1P0C2W7 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
CT47B1P0C2W7 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
CT47B1P0C2W7 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
CT47B1P0C2W7 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
CT47B1P0C2W7 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
CT47B1P0C2W7 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
CT47B1P0C2W7 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
CT47B1P0C2W7 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
CT47B1P0C2W7 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
CT47B1P0C2W7 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
CT47B1P0C2W7 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
CT47B1P0C2W7 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC28.64■■■□□ 2.18
CT47B1P0C2W7 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
CT47B1P0C2W7 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
CT47B1P0C2W7 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
CT47B1P0C2W7 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.17
CT47B1P0C2W7 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
CT47B1P0C2W7 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.17
CT47B1P0C2W7 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.17
CT47B1P0C2W7 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
CT47B1P0C2W7 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
CT47B1P0C2W7 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
CT47B1P0C2W7 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
CT47B1P0C2W7 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
CT47B1P0C2W7 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
CT47B1P0C2W7 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
CT47B1P0C2W7 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
CT47B1P0C2W7 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
CT47B1P0C2W7 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
CT47B1P0C2W7 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
CT47B1P0C2W7 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
CT47B1P0C2W7 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
CT47B1P0C2W7 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
CT47B1P0C2W7 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
CT47B1P0C2W7 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
CT47B1P0C2W7 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
CT47B1P0C2W7 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
CT47B1P0C2W7 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
CT47B1P0C2W7 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
CT47B1P0C2W7 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
CT47B1P0C2W7 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
CT47B1P0C2W7 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
CT47B1P0C2W7 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
CT47B1P0C2W7 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
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