Protein–RNA interactions for Protein: P09496

CLTA, Clathrin light chain A, humanhuman

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLTAP09496 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CLTAP09496 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
CLTAP09496 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CLTAP09496 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CLTAP09496 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CLTAP09496 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CLTAP09496 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CLTAP09496 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CLTAP09496 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
CLTAP09496 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CLTAP09496 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CLTAP09496 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CLTAP09496 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CLTAP09496 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
CLTAP09496 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
CLTAP09496 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
CLTAP09496 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CLTAP09496 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CLTAP09496 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CLTAP09496 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CLTAP09496 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CLTAP09496 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CLTAP09496 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CLTAP09496 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CLTAP09496 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CLTAP09496 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CLTAP09496 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CLTAP09496 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CLTAP09496 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
CLTAP09496 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CLTAP09496 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CLTAP09496 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CLTAP09496 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CLTAP09496 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CLTAP09496 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CLTAP09496 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CLTAP09496 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CLTAP09496 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CLTAP09496 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
CLTAP09496 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CLTAP09496 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CLTAP09496 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CLTAP09496 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CLTAP09496 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CLTAP09496 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CLTAP09496 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CLTAP09496 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CLTAP09496 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CLTAP09496 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
CLTAP09496 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CLTAP09496 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
CLTAP09496 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
CLTAP09496 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CLTAP09496 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CLTAP09496 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
CLTAP09496 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
CLTAP09496 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
CLTAP09496 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CLTAP09496 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CLTAP09496 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CLTAP09496 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CLTAP09496 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
CLTAP09496 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CLTAP09496 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CLTAP09496 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CLTAP09496 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CLTAP09496 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CLTAP09496 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CLTAP09496 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CLTAP09496 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CLTAP09496 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CLTAP09496 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CLTAP09496 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CLTAP09496 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CLTAP09496 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CLTAP09496 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CLTAP09496 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CLTAP09496 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CLTAP09496 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
CLTAP09496 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
CLTAP09496 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
CLTAP09496 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
CLTAP09496 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CLTAP09496 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CLTAP09496 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CLTAP09496 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
CLTAP09496 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CLTAP09496 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CLTAP09496 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CLTAP09496 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CLTAP09496 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CLTAP09496 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CLTAP09496 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CLTAP09496 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CLTAP09496 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
CLTAP09496 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CLTAP09496 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CLTAP09496 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CLTAP09496 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CLTAP09496 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.2 ms