Protein–RNA interactions for Protein: P09327

VIL1, Villin-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 827 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VIL1P09327 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
VIL1P09327 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
VIL1P09327 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
VIL1P09327 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
VIL1P09327 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
VIL1P09327 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
VIL1P09327 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
VIL1P09327 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
VIL1P09327 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
VIL1P09327 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC27.05■■□□□ 1.92
VIL1P09327 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
VIL1P09327 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
VIL1P09327 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
VIL1P09327 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
VIL1P09327 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
VIL1P09327 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
VIL1P09327 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
VIL1P09327 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
VIL1P09327 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
VIL1P09327 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
VIL1P09327 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
VIL1P09327 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
VIL1P09327 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
VIL1P09327 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC27.03■■□□□ 1.92
VIL1P09327 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
VIL1P09327 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
VIL1P09327 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
VIL1P09327 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
VIL1P09327 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
VIL1P09327 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
VIL1P09327 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
VIL1P09327 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
VIL1P09327 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
VIL1P09327 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
VIL1P09327 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
VIL1P09327 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
VIL1P09327 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
VIL1P09327 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
VIL1P09327 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
VIL1P09327 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC27.02■■□□□ 1.92
VIL1P09327 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
VIL1P09327 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.92
VIL1P09327 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
VIL1P09327 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
VIL1P09327 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
VIL1P09327 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
VIL1P09327 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
VIL1P09327 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
VIL1P09327 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
VIL1P09327 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
VIL1P09327 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
VIL1P09327 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
VIL1P09327 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
VIL1P09327 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
VIL1P09327 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
VIL1P09327 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
VIL1P09327 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
VIL1P09327 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
VIL1P09327 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC27■■□□□ 1.91
VIL1P09327 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
VIL1P09327 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
VIL1P09327 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
VIL1P09327 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
VIL1P09327 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
VIL1P09327 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
VIL1P09327 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC26.99■■□□□ 1.91
VIL1P09327 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
VIL1P09327 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
VIL1P09327 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
VIL1P09327 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
VIL1P09327 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
VIL1P09327 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
VIL1P09327 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
VIL1P09327 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
VIL1P09327 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC26.98■■□□□ 1.91
VIL1P09327 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
VIL1P09327 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
VIL1P09327 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
VIL1P09327 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
VIL1P09327 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
VIL1P09327 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
VIL1P09327 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
VIL1P09327 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
VIL1P09327 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
VIL1P09327 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
VIL1P09327 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
VIL1P09327 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
VIL1P09327 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
VIL1P09327 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
VIL1P09327 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
VIL1P09327 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
VIL1P09327 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
VIL1P09327 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
VIL1P09327 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
VIL1P09327 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
VIL1P09327 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
VIL1P09327 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
VIL1P09327 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
VIL1P09327 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
VIL1P09327 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms