Protein–RNA interactions for Protein: P07498

CSN3, Kappa-casein, humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSN3P07498 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
CSN3P07498 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CSN3P07498 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CSN3P07498 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CSN3P07498 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CSN3P07498 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CSN3P07498 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CSN3P07498 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CSN3P07498 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CSN3P07498 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CSN3P07498 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CSN3P07498 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CSN3P07498 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CSN3P07498 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CSN3P07498 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CSN3P07498 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CSN3P07498 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CSN3P07498 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CSN3P07498 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CSN3P07498 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CSN3P07498 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CSN3P07498 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
CSN3P07498 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CSN3P07498 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CSN3P07498 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CSN3P07498 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CSN3P07498 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CSN3P07498 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CSN3P07498 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CSN3P07498 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CSN3P07498 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CSN3P07498 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CSN3P07498 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CSN3P07498 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CSN3P07498 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CSN3P07498 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CSN3P07498 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CSN3P07498 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CSN3P07498 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CSN3P07498 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CSN3P07498 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CSN3P07498 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CSN3P07498 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CSN3P07498 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CSN3P07498 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CSN3P07498 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CSN3P07498 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CSN3P07498 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CSN3P07498 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CSN3P07498 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CSN3P07498 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CSN3P07498 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CSN3P07498 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CSN3P07498 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CSN3P07498 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
CSN3P07498 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CSN3P07498 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CSN3P07498 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CSN3P07498 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CSN3P07498 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CSN3P07498 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CSN3P07498 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CSN3P07498 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CSN3P07498 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CSN3P07498 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CSN3P07498 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CSN3P07498 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CSN3P07498 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CSN3P07498 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CSN3P07498 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CSN3P07498 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CSN3P07498 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CSN3P07498 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CSN3P07498 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CSN3P07498 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CSN3P07498 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CSN3P07498 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CSN3P07498 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CSN3P07498 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CSN3P07498 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CSN3P07498 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CSN3P07498 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CSN3P07498 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CSN3P07498 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CSN3P07498 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CSN3P07498 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CSN3P07498 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CSN3P07498 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CSN3P07498 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CSN3P07498 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CSN3P07498 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CSN3P07498 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CSN3P07498 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CSN3P07498 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CSN3P07498 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CSN3P07498 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CSN3P07498 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CSN3P07498 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
CSN3P07498 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CSN3P07498 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms